r - 如何从 summaryRprof 中绘制图表？

Question

这是一个大学作业的问题。

给了我三个算法来计算我已经做过的 GCD。我的问题是将 Rprof 结果绘制成图表，以便我可以并排比较它们。

根据我对 Rprof、summaryRprof 和 plot 的一点了解，Rprof 是这样使用的:

Rprof() #To start
#functions here
Rprof(NULL)  #TO end
summaryRprof() # to print results

我知道 plot 有许多不同类型的输入、x 和 y 值以及称为数据框的东西，我认为它是表的一个花哨的词。并绘制不同的线条和我需要使用的东西:http://www.harding.edu/fmccown/r/

我想不通的是如何将 summaryRprof 结果传递给 plot() 函数。

> Rprof(filename="RProfOut2.out", interval=0.0001)
> gcdBruteForce(10000, 33)
[1] 1
> gcdEuclid(10000, 33)
[1] 1
> gcdPrimeFact(10000, 33)
[1] 1
> Rprof(NULL)
> summaryRprof()
?????plot????

我一直在阅读有关堆栈溢出的内容以及其他我也可以尝试使用 profr 和 proftools 的网站，尽管我对用法不是很清楚。

我能够制作的唯一图表是使用 plot(system.time(gcdFunction(10,100)))

一如既往地感谢任何帮助。

Answer 1

有两个可视化Rprof输出的包:

• profr作者:哈德利·威克姆

• proftools作者:卢克·蒂尔尼

在安装了 graphviz 的 Unix/OS X 系统上，您可以使用由 Romain Francois 编写的精美 Perl 脚本，该脚本位于 R Wiki page on profiling。 .

所有这些都通过我的 Intro to HPC with R 教程中的示例进行了描述，您可以找到例如here .