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r - rowSums(Qf) 错误: 'x' 必须是至少二维数组 (msm::msm2surv)

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-04 12:06:53 24 4
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我正在使用 msm 包中的函数 msm2surv 并尝试将纵向数据转换为 flexsurve 包喜欢的格式。以下是我名为 tmp 的示例。

tmp <- structure(list(id = c(89, 90, 90, 91, 91, 91, 92, 92, 93, 93, 
94, 94, 94, 95, 95, 96), days = c(9157, 0, 9156, 0, 8394, 9156,
0, 9156, 0, 8079, 0, 8933, 9003, 0, 8430, 0), event = c(1, 1,
1, 1, 2, 2, 1, 1, 1, 5, 1, 3, 6, 1, 4, 1)), row.names = c(NA,
-16L), class = c("grouped_df", "tbl_df", "tbl", "data.frame"), vars = "id", drop = TRUE, indices = list(
0L, 1:2, 3:5, 6:7, 8:9, 10:12, 13:14, 15L), group_sizes = c(1L,
2L, 3L, 2L, 2L, 3L, 2L, 1L), biggest_group_size = 3L, labels = structure(list(
id = c(89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96)), row.names = c(NA,
-8L), class = "data.frame", vars = "id", drop = TRUE, .Names = "id"), .Names = c("id",
"days", "event"))

运行代码:

library(msm)
Q <- matrix(c(
0,1,1,1,1,0,
0,0,1,1,1,1,
0,0,0,1,1,1,
0,0,0,0,1,1,
0,0,0,0,0,0,
0,0,0,0,0,0
), nrow=6, ncol=6,
byrow=TRUE,
dimnames=list(from=1:6,to=1:6))

dat <- msm2Surv(data=tmp, subject="id", time="days", state="event", Q=Q)

它给了我错误:rowSums(Qf) 中的错误:'x' 必须是至少两个维度的数组。

我检查了数据框的维度,听起来没问题。但错误就在那里。每个人都知道如何解决问题/错误吗?

非常感谢!

最佳答案

我们可以将 tbl_df 转换为 data.frame,它应该可以工作

out <- msm2Surv(data=as.data.frame(tmp), subject="id",
time="days", state="event", Q=Q)
dim(out)
#[1] 31 8

“tmp”数据集是一个分组的 tbl_df 并且有很多属性。通过转换为 data.frame,我们删除了这些属性。

关于r - rowSums(Qf) 错误: 'x' 必须是至少二维数组 (msm::msm2surv),我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/51194732/

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