r - 如何使用 knitr 生成 GitHub 风格的 Markdown 文件？

Question

我喜欢使用 knitr 生成动态报告并使用 GitHub 与我的同事共享。我通常做的是编写我的 Rmarkdown 脚本 -- knit ('myfile.Rmd') -- 并生成一个 Markdown ( myfile.md ) 版本，可以在 GitHub 上直接看到。 GitHub 上的 Markdown 文件比 knitr 用 pandoc 生成的 HTML 文件对我来说要好得多。

这个工作流程通常完美无缺，除非我想显示表格。目前我正在使用 kable如果最终产品是 HTML 文件，则在 R-chunk 中效果很好。

我的 R-chunk 看起来像:

```{r}
library (knitr)
data (cars)
kable (head (cars))
```

当 kable从控制台调用，我得到了我想要的管道表:

| speed| dist|
|-----:|----:|
|     4|    2|
|     4|   10|
|     7|    4|
|     7|   22|

其中 是 GitHub 很好地展示了。

然而，什么 knit('myfile.Rmd')生成于 myfile.md (当 kable 从 R-chunk 中调用时)是一个简单的表

speed   dist
------  -----
    4      2
    4     10
    7      4
    7     22

其中 不是 GitHub 很好地展示了。

有什么方法可以使我的 Markdown 文件中的表格与 GitHub 风格的 Markdown 兼容吗？也许有一个 knitr或 kable()我不知道的选项？或者也许有替代 kable达到预期的效果？

Answer 1

Pandoc 可以通过 -t markdown_github 输出到 github 风格的 markdown .使用 knitr 将是:

library(knitr)
pandoc('input.md', format='markdown_github')