r - 报告 R 包中的 tex2docx 函数出错

Question

我正在尝试重现 tex2docx 的示例函数在 reports R打包并收到以下错误。

DOC <- system.file("extdata/doc_library/apa6.qual_tex/doc.tex",
   package = "reports")
BIB <- system.file("extdata/docs/example.bib", package = "reports")
tex2docx(DOC, file.path(getwd(), "test.docx"), path = NULL, bib.loc = BIB)

错误信息

pandoc.exe: Error reading bibliography `C:/Users/Muhammad'
citeproc: the format of the bibliographic database could not be recognized
using the file extension.
docx file generated!
Warning message:
running command 'C:\Users\MUHAMM~1\AppData\Local\Pandoc\pandoc.exe -s C:/Users/Muhammad Yaseen/R/win-library/3.0/reports/extdata/doc_library/apa6.qual_tex/doc.tex -o C:/Users/Muhammad Yaseen/Documents/test.docx --bibliography=C:/Users/Muhammad Yaseen/R/win-library/3.0/reports/extdata/docs/example.bib' had status 23

我想知道如何获得 tex2docx函数在 reports R包工作正常。

Answer 1

如上述注释中所述，错误是由传递包含一些未转义或引用的空格的文件名/路径引起的。解决方法可能是将所有文件路径和名称包装在 shQuote 中。在使用 system 传递到命令行之前.

代码:https://github.com/trinker/reports/pull/31

演示:

加载包

library(reports)

创建一个名称中带有空格的虚拟目录，用于保存 bib文件

dir.create('foo bar')
file.copy(system.file("extdata/docs/example.bib", package = "reports"), 'foo bar/example.bib')

指定来源和复制的 bib文件:

DOC <- system.file("extdata/doc_library/apa6.qual_tex/doc.tex", package = "reports")
BIB <- 'foo bar/example.bib'

运行测试:

tex2docx(DOC, file.path(getwd(), "test2.docx"), path = NULL, bib.loc = BIB)

免责声明:我试图测试这个拉取请求，但我无法设置一个包含所有运行所需工具的环境 R CMD check毕竟在 5 分钟内有小插曲和其他所有内容(抱歉，现在正在度假，午饭后只是享受午睡)，所以请将此拉取请求视为“未经测试”——尽管它应该可以工作。