r - 如何隐藏表格底部的方差分析显着性水平

Question

假设我使用 anova() 比较了两个嵌套随机效应模型，结果如下:

new.model: new
current.model: new 
              Df    AIC    BIC  logLik  Chisq Chi Df Pr(>Chisq)    
new.model      8 299196 299259 -149590                             
current.model  9 299083 299154 -149533 115.19      1  < 2.2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 

我只想使用表格部分(见下文):

              Df    AIC    BIC  logLik  Chisq Chi Df Pr(>Chisq)    
new.model      8 299196 299259 -149590                             
current.model  9 299083 299154 -149533 115.19      1  < 2.2e-16 ***

我知道我可以通过使用 attributes(anova.object)$heading = NULL 将标题设置为 null 来摆脱标题部分(见blow)，但我不知道如何摆脱底部部分:Signif .代码:.....

new.model: new
current.model: new

我非常不想使用 data.frame(见下文)，因为它将空白单元格更改为 NAs

data.frame(anova(new.model, current.model))
              Df      AIC      BIC    logLik    Chisq Chi.Df   Pr..Chisq.
new.model      8 299196.4 299258.9 -149590.2       NA     NA           NA
current.model  9 299083.2 299153.6 -149532.6 115.1851      1 7.168247e-27

我想知道你们是否知道处理这种情况的方法。

[更新]:我最终使用 print.anova 编写了一个包装器:

anova.print = function(object, signif.stars = TRUE, heading = TRUE){
    if(!heading)
         attributes(object)$heading = NULL
    print.anova(object, signif.stars = signif.stars)
}

例子:

dv = c(rnorm(20), rnorm(20, mean=2), rnorm(20))
iv = factor(rep(letters[1:3], each=20))
anova.object = anova(lm(dv~iv))

Analysis of Variance Table
Response: dv 
          Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)    
iv         2 46.360 23.1798  29.534 1.578e-09 ***
Residuals 57 44.737  0.7849                      
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1 


anova.print(anova.object, F, F)
          Df Sum Sq Mean Sq F value    Pr(>F)
iv         2 46.360 23.1798  29.534 1.578e-09
Residuals 57 44.737  0.7849             

Answer 1

前几天我们有一篇关于不显示 NA 的类似帖子。你可以这样做:

x <- as.matrix(anova(new.model, current.model))
print(x, na.print="", quote=FALSE)

使用 mtcars 数据集的更可重现的示例:

x <- as.matrix(anova(lm(hp~mpg+am, data=mtcars)))
print(x, na.print="", quote=FALSE)