r - 尽管处于 64 位版本，但无法在 R 中分配向量

Question

我正在尝试在 R 中进行 dcast 以生成矩阵，如 another question I asked 所示。

但是，我收到一个错误:

Error: cannot allocate vector of size 2.8Gb.

我的桌面有 8GB 的​​ RAM，我运行的是 ubuntu 11.10 64 位版本。我可能使用了错误版本的 R 吗？我怎么知道，有没有办法在运行 R 时确定它？我肯定必须有必要的空间来分配这个向量。

Answer 1

错误消息意味着 R 需要分配 另一个 2.8Gb 的内存来完成您尝试执行的任何操作。这并不意味着它需要分配最大 2.8Gb。在运行该 R 代码的同时在 shell 中运行 top 并观察 R 如何使用内存，直到它达到无法使用额外 2.8Gb 的地址空间的程度。

盒子上有很大的交换空间吗？我可以很容易地看到你正在做什么使用所有 8Gb 的 RAM 加上你所有的交换空间，因此 R 没有其他地方可以从中获取内存空间并因此引发错误。

也许您可以尝试分 block 进行 dcast，或者尝试使用 dcast 以外的替代方法。如果您需要帮助，请发布另一个 Q。