r - 应用两个数据框

Question

我正在使用 R，并且我有两个 data.frames，A和 B .它们都有 6 行，但是 A有 25000 列(基因)，和 B有 30 列。我想应用一个带有两个参数的函数 f(x,y)哪里x是 A 的每一列和 y是 B 的每一列.到目前为止它看起来像这样:

i = 1
for (x in A){
    j = 1
    for (y in B){
        out[i,j] <- f(x,y)
        j = j + 1
    }
    i = i + 1
}

我对此有两个问题:从我的 Python 编程中，我认为跟踪这样的计数器很笨拙，而从我的 R 编程中，我对 for 循环感到紧张。但是，我不太明白如何申请 apply (或者即使我应该应用 apply )来解决这个问题，并希望有人能启发我。我需要治疗 f()现在作为原子(实际上是 cor.test() )。

Answer 1

由于您使用的是数据框，因此使用 lapply 或 sapply 执行此操作可能会更快(特别是考虑到数据框的范围)。例如，

x <- data.frame(col1=c(1,2,3,4), col2=c(5,6,7,8), col3=c(9,10,11,12))
y <- data.frame(col1=c(1,2,3,4), col2=c(5,6,7,8))
bl <- lapply(x, function(u){
   lapply(y, function(v){
       f(u,v) # Function with column from x and column from y as inputs
   })
})
out = matrix(unlist(bl), ncol=ncol(y), byrow=T)