r - 将顶点大小与 igraph 中的标签大小匹配

Question

我正在尝试在 R 中使用 igraph 绘制小型网络。网络中的每个顶点都有一个名称，相当于它的标签。我想让每个顶点都有一个矩形符号，它的大小刚好适合它的标签。

这是我的主要灵感。



使用 igraph 执行此操作的最佳方法是什么？

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代码是here

jsonToNM <- function(jfile, directed=TRUE) {
  # Requires "rjson" and "igraph"

  nm.json <- fromJSON(file=jfile)
  nm.graph <- c()

  # Initialize the graph with the given nodes
  g <- graph.empty(n=length(nm.json), directed=directed)
  # Add their names
  V(g)$name <- names(nm.json)
  V(g)$label <- V(g)$name

  # Now, add the edges
  for(i in 1:length(nm.json)) {
    # If the node has a "connected" field,
    # then we note the connections by looking
    # the names up.
    if(length(nm.json[[i]]$connected > 0)) {
      for(j in 1:length(nm.json[[i]]$connected)) {
        # Add the entry
        g <- g + edge(names(nm.json)[i],
                        nm.json[[i]]$connected[j])
      }
    }
  }

  plot(g, vertex.label.dist=1.5)
}

目前的输出低于。



我的目标是将标签放置在顶点图形内，并扩展顶点的宽度以容纳标签。

Answer 1

这是一个例子。在一些肮脏的技巧(即将顶点大小乘以 200)中，关键是使用两个绘图命令，以便我们可以使用 strwidth() 来测量标签的宽度(和高度)。 , 在使用第一个(空)绘图设置绘图大小之后。

library(igraph)
camp <- graph.formula(Harry:Steve:Don:Bert - Harry:Steve:Don:Bert,
                      Pam:Brazey:Carol:Pat - Pam:Brazey:Carol:Pat,
                      Holly   - Carol:Pat:Pam:Jennie:Bill,
                      Bill    - Pauline:Michael:Lee:Holly,
                      Pauline - Bill:Jennie:Ann,
                      Jennie  - Holly:Michael:Lee:Ann:Pauline,
                      Michael - Bill:Jennie:Ann:Lee:John,
                      Ann     - Michael:Jennie:Pauline,
                      Lee     - Michael:Bill:Jennie,
                      Gery    - Pat:Steve:Russ:John,
                      Russ    - Steve:Bert:Gery:John,
                      John    - Gery:Russ:Michael)

V(camp)$label <- V(camp)$name
set.seed(42)   ## to make this reproducable
co <- layout.auto(camp)

plot(0, type="n", ann=FALSE, axes=FALSE, xlim=extendrange(co[,1]), 
     ylim=extendrange(co[,2]))
plot(camp, layout=co, rescale=FALSE, add=TRUE,
     vertex.shape="rectangle",
     vertex.size=(strwidth(V(camp)$label) + strwidth("oo")) * 100,
     vertex.size2=strheight("I") * 2 * 100)

顺便提一句。这对于 SVG 图形来说不太好用，因为无法从 R 测量文本的宽度，SVG 设备只能进行猜测。