r - 如何在热图中画一条直线

Question

我正在为一些数据制作热图，并想在每组样本之间添加一条直线。似乎 abline 在 heatmap 上效果不佳。

知道我可以为此目的使用什么功能吗？

Answer 1

您必须使用 add.expr 参数。这个例子找到了here可能有用:

x  <- as.matrix(mtcars)
rc <- rainbow(nrow(x), start=0, end=.3)
cc <- rainbow(ncol(x), start=0, end=.3)
hv <- heatmap(x, col = cm.colors(256), scale="column",
               RowSideColors = rc, ColSideColors = cc, margin=c(5,10),
               xlab = "specification variables", ylab= "Car Models",
               main = "heatmap(<Mtcars data>, ..., scale = \"column\")",
               # IMPORTANT BIT HERE
               add.expr = abline(h=5, v=2))