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将所有data.frames转换为data.tables之后立即使用:=
时,我会收到警告:
library(data.table) #Win R-3.5.1 x64 data.table_1.12.2
df1 <- data.frame(A=1, B=2)
df2 <- data.frame(D=3)
lapply(mget(ls()), function(x) {
if (is.data.frame(x)) {
setDT(x)
}
})
df1[, rn:=.I]
Warning message: In
[.data.table
(df1, ,:=
(rn, .I)) : Invalid .internal.selfref detected and fixed by taking a (shallow) copy of the data.table so that := can add this new column by reference. At an earlier point, this data.table has been copied by R (or was created manually using structure() or similar). Avoid names<- and attr<- which in R currently (and oddly) may copy the whole data.table. Use set* syntax instead to avoid copying: ?set, ?setnames and ?setattr. If this message doesn't help, please report your use case to the data.table issue tracker so the root cause can be fixed or this message improved.
df3 <- data.frame(E=3)
df4 <- data.frame(FF=4)
for (l in list(df3, df4)) setDT(l)
df3[, rn:=.I]
df5 <- data.frame(G=5)
setDT(df5)
df[, rn := .I] #no warning
最佳答案
有点晚了,但是使用eapply()
(以及list2env()
)似乎是一种很棒的方法,并且很少见。当然,这是另一种选择,当然不能断言这是惯用的方式。
library(data.table)
df1 <- data.frame(A=1, B=2)
df2 <- data.frame(D=3)
list2env(eapply(.GlobalEnv, function(x) {if(is.data.frame(x)) {setDT(x)} else {x}}), .GlobalEnv)
df1[, rn:=.I]
df1
A B rn
1: 1 2 1
set.seed(0L)
sz <- 1e7
df1 <- data.frame(A=rnorm(sz))
df2 <- data.frame(B=rnorm(sz))
df3 <- copy(df1)
df4 <- copy(df2)
microbenchmark::microbenchmark(unit="ms", times=1L,
assign_mtd = {
for (x in ls()) {
if (is.data.frame(get(x))) {
assign(x, as.data.table(get(x)))
}
}
},
eval_sub_mtd = {
for(x in ls()){
if (is.data.frame(get(x))) {
eval(substitute(setDT(x), list(x=as.name(x))))
}
}
},
eapply_mtd = {
list2env(eapply(.GlobalEnv, function(x) {
if (is.data.frame(x)) setDT(x) else x
}), .GlobalEnv)
}
)
Unit: milliseconds
expr min lq mean median uq max neval
assign_mtd 115.922802 115.922802 115.922802 115.922802 115.922802 115.922802 1
eval_sub_mtd 3.293358 3.293358 3.293358 3.293358 3.293358 3.293358 1
eapply_mtd 1.913802 1.913802 1.913802 1.913802 1.913802 1.913802 1
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