r - 从优势比和置信区间进行 Meta 分析，在 r 中使用 metafor 包

Question

我正在尝试从多个优势比及其置信区间进行荟萃分析。源文章不报告标准错误。

为了使用rma.uni()来自 metafor包，我需要提供差异(通过 vi=" " )或标准错误(通过 sei = " " )。所以我用以下方式计算了标准误差 (logor = log(odds ratio), UL= CI upper limit, LL = CI lower limit) :

se1<-(log(UL)-logor)/1.96
se2<-(log(OR)-log(LL))/1.96

我的问题是，以这种方式得出的标准错误略有不同，尽管它们应该是相同的。我认为这是因为 CI 被作者四舍五入了。我的解决方案是将这些的平均值作为模型中的标准误差。

但是，当我拟合模型并绘制森林图时，得到的置信区间与我开始时的置信区间有很大不同。

dmres<-rma.uni(yi=logor, sei=se, data=dm2)
forest(dmres, atransf=exp, slab=paste(dm2$author))

有一个更好的方法吗？
也许我可以直接输入置信区间的函数？

非常感谢您的评论。

更新

示例数据和代码:

dm<-structure(list(or = c(1.6, 4.4, 1.14, 1.3, 4.5), cill = c(1.2, 
2.9, 0.45, 0.6, 3.2), ciul = c(2, 6.9, 2.86, 2.7, 6.1)), .Names = c("or", 
"cill", "ciul"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -5L))

dm$logor<-log(dm$or)
dm$se1<-(log(dm$ciul)-dm$logor)/1.96
dm$se2<-(dm$logor-log(dm$cill))/1.96
dm$se<-(dm$se1+dm$se2)/2

library(metafor)
dmres<-rma.uni(yi=logor, sei=se, data=dm)
forest(dmres, atransf=exp)

Answer 1

由于置信区间界限(在对数刻度上)一开始不是对称的，因此您会得到这些差异。您可以使用 forest.default()函数，直接提供 CI 边界，然后添加带有 addpoly() 的汇总多边形功能。使用您的示例:

forest(dm$logor, ci.lb=log(dm$cill), ci.ub=log(dm$ciul), atransf=exp, rows=7:3, ylim=c(.5,10))
addpoly(dmres, row=1, atransf=exp)
abline(h=2)

将确保数据集中的 CI 边界与森林图中的完全相同。