r - 在 Windows 7 包 doSMP 上使用 64 位在 R 中进行并行处理

Question

我已经在 Windows 7 上安装了 R(64 位)版本 2.11.1，并且还从“REvolution foreach windows bundle”中打包了 doSMP 和 revoIPC 以进行并行处理。然后我将库 doSMP 上传到 R 并从 R 收到以下消息

> library(doSMP)
Loading required package: revoIPC
Error: package 'revoIPC' is not installed for 'arch=x64'

如何解决这个问题？似乎 doSMP 适用于 R 的 32 位分布，但不适用于 64 位分布。

我还测试了以下程序

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require(doSMP)
workers <- startWorkers(4) # My computer has 2 cores
registerDoSMP(workers)

# create a function to run in each itteration of the loop
check <-function(n) {
 for(i in 1:1000)
 {
  sme <- matrix(rnorm(100), 10,10)
  solve(sme)
 }
}


times <- 10 # times to run the loop

# comparing the running time for each loop
system.time(x <- foreach(j=1:times ) %dopar% check(j))  #  2.56 seconds  (notice that the first run would be slower, because of R's lazy loading)
system.time(for(j in 1:times ) x <- check(j))  #  4.82 seconds

# stop workers
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我从 R 收到以下消息

> workers <- startWorkers(4) # My computer has 2 cores
Error: could not find function "startWorkers"
> registerDoSMP(workers)
Error: could not find function "registerDoSMP"

非常感谢您的帮助。

托尼

Answer 1

错误信息

Loading required package: revoIPC
Error: package 'revoIPC' is not installed for 'arch=x64'

非常明确:您正在运行 64 位 R，但您没有加载 doSMP 所需的所有子组件，特别是包裹 revoIPC不见了。

如果您是 Revo 客户，请联系他们。如果没有，那么您可能需要为 R 考虑不同的并行计算解决方案。