r - 如何编写一个函数来创建用于 ggplot2 的自定义误差线？

Question

Ggplot2 允许在绘图中添加误差线。为了为您计算误差线限制，它包装了 Hmisc 中的函数。例如，可以使用 mean_cl_boot 选项进行引导:

m <- ggplot(mtcars, aes(x=cyl, y=am)) + stat_summary(fun.y=mean,geom="point")
m2 <- m + stat_summary(fun.data = "mean_cl_boot", geom = "errorbar", conf.int=.95)
m2

但是，如果您需要编写自定义函数来计算误差线限制，该怎么办？应该如何编写函数以从 stat_summary 调用中调用？

Answer 1

这是一个使用来自 PropCIs 的 add4ci 函数提供置信区间的示例。你只需要让函数返回一个名为“y”、“ymin”和“ymax”的数字列表:

library(PropCIs)
add4ciForGgplot <- function(x,conf.int) {
  numCorrect <- sum(x)
  numTrials <- length(x)
  CI <- add4ci(numCorrect,numTrials,conf.int)
  triplet <- data.frame(numCorrect/numTrials, CI$conf.int[1], CI$conf.int[2])
  names(triplet) <- c("y","ymin","ymax") #this is what ggplot is expecting
  return (triplet)
}

m <- ggplot(mtcars, aes(x=cyl, y=am)) + stat_summary(fun.y=mean,geom="point")
mCustom <- m + stat_summary(fun.data = "add4ciForGgplot", geom = "errorbar", conf.int=.95)
mCustom