R CMD构建跳过了knitr/Rmd vignettes- "Output(s) listed in ' build/vignette.rds，但不在软件包中”

Question

我已经为R软件包构建了rmarkdown教程，并希望在构建软件包时包括已编译的文件。尽管文件编译愉快(包括使用R CMD Sweave进行编译时)，但似乎无法将其包含在二进制文件中。

具体来说，当我运行R CMD BUILD时，我得到

* checking for file ‘./DESCRIPTION’ ... OK
[snip]
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... OK
* checking for empty or unneeded directories
Removed empty directory ‘rentrez/inst/doc’
Removed empty directory ‘rentrez/inst’
Removed empty directory ‘rentrez/vignettes/assets’
Removed empty directory ‘rentrez/vignettes’
* building ‘rentrez_0.2.4.tar.gz’

但是，在安装此二进制文件并运行 vignette(package="rentrez")之后，该程序包没有小插图。

那么，我在做什么错呢？

如果有帮助，库的 this branch包含小插图以及对该程序包的相关编辑。 file itself在 vignettes/目录中，并以

<!--
%\VignetteEngine{knitr::knitr}
%\VignetteIndexEntry{rentrez tutorial}
-->

DESCRIPTION文件包括以下几行

Suggests:
    testthat,-
VignetteBuilder: knitr

编辑

我应该考虑在已构建的程序包上运行 R CMD CHECK:

Output(s) listed in 'build/vignette.rds' but not in package:
  ‘inst/doc/rentrez_vignette.html’

据我所知， build/vignette.rds是由 R CMD BUILD创建的，但我不知道为什么它指向 inst/doc(即使在构建软件包之前已删除此目录)

Answer 1

问题是您的rentrez_*中包含.Rbuildignore，并且与小插图的名称匹配。 .Rbuildignore中的行应如下所示

^staticdocs$

不是

staticdocs