r - 如何在R中正确设置库目录/路径

Question

我的目标是定义R将用于安装和搜索库的单个路径。我read可以通过更改Rprofile.site安装路径中的R文件来完成。我在那里尝试了两个命令:

.libPaths("D:/RLibrary")
.Library.site <- file.path("D:/RLibrary")

我什至在阅读帮助文件后仍不完全了解其中的区别。

但是，在启动 R之后，仍会在两个位置中查找库。

.libPaths()
[1] "D:/RLibrary"                        "C:/Program Files/R/R-3.3.1/library"

为什么会这样，以及如何仅将库路径更改为所需的路径？

Answer 1

我建议您不要为软件包使用单个目录，因为R附带了许多基本软件包。相反，您希望有一个目录供用户安装软件包。

创建一个.Renviron文件，并添加环境变量R_LIBS指向您希望包最终进入的目录。在我的机器上，我有

# Linux 
R_LIBS=/data/Rpackages/

或者如果您有Windows之类的

# Windows
R_LIBS=C:/R/library

您的 .libPaths()现在看起来像

R> .libPaths()
[1] "/data/Rpackages"   "/usr/lib/R/site-library"

这意味着当我安装软件包时，它会转到 /data/ncsg3/Rpackages
如果您确实只想拥有一个目录，则可以将 R_LIBS_SITE变量设置为忽略默认目录。