requireNamespaceQuietStop 在自定义 summaryFunction 插入符号中导致错误

Question

我“更新”了 caret 中的 twoClassSummary 函数，以使用 caret 函数包括阴性和阳性预测值:

testfun <- function (data, lev = NULL, model = NULL) 
{
  lvls <- levels(data$obs)
  if (length(lvls) > 2) 
    stop(paste("Your outcome has", length(lvls), "levels. The 
twoClassSummary() function isn't appropriate."))
  requireNamespaceQuietStop("ModelMetrics")
  if (!all(levels(data[, "pred"]) == lvls)) 
    stop("levels of observed and predicted data do not match")
  data$y = as.numeric(data$obs == lvls[2])
  rocAUC <- ModelMetrics::auc(ifelse(data$obs == lev[2], 0, 
                                     1), data[, lvls[1]])
  out <- c(rocAUC, sensitivity(data[, "pred"], data[, "obs"], lev[1]), 
                   specificity(data[, "pred"], data[, "obs"], lev[2]),
                   # next 3 lines are my additions and modifications
                   negPredValue(data[, "obs"], data[, "pred"], lev[2]),
                   posPredValue(data[, "obs"], data[, "pred"], lev[1]))
  names(out) <- c("ROC", "Sens", "Spec", "NPV", "PPV")
  out
}

然后我的 trainControl 功能:

train_control <- trainControl(method = 'repeatedcv', 
                              number = 10, repeats = 3,
                              summaryFunction = testfun,
                              classProbs = T,
                              savePredictions = T)

然后我的模型功能:

modelSvm <- train(target ~ ., data = twoClassData, trControl = train_control, method = 'svmRadial')

问题是当我运行这个函数时，我收到错误
ctrl$summaryFunction(testOutput, lev, method) 中的错误:
找不到函数“requireNamespaceQuietStop”

即使我没有改变函数的那部分。

如果我输入

twoClassSummary

在控制台中，

环境:命名空间:插入符号

在函数定义之后的末尾出现(在 < > 符号之间)，我相信这是我的问题的根源。

1) 如何在函数中将 R 定向到此环境？和
2)准确性不是预定义的插入符号函数，有关如何将准确性工作到此代码中的任何建议？

提前致谢....

Answer 1

该函数不是由 caret 导出的，所以使用 caret::: requireNamespaceQuietStop代替(或使用使用过的 library )。