r - 如何可视化 20 万行和 100 列数据

Question

R 的热图和 pheatmap 因抛出此错误而无法生成集群。

Error in vector("double", length) : vector size specified is too large

有谁知道我如何可视化那个大矩阵？

Answer 1

hexbin 包旨在有效地汇总大量二维显示。只有超过一千万点，这在我 3 岁的 Mac 上才会有所减慢。 (老实说，@James，我确实独立地想到了这一点。)这是对其帮助页面之一中的示例进行的次要修改:

 require(hexbin)
 h <- hexbin(rnorm(10000),rnorm(10000))
  plot(h, colramp= function(n){magent(n,beg=15,end=225)})