r - UpsetR 更改图中的集名称标签

Question

我正在尝试将 UpsetR 图中的集合名称标签(使用 Upset 函数)更改为由多个单词组成的字符串。我希望设置标签显示为“A 描述”、“B 描述”、“C 描述”，而不是“A”、“B”、“C”。我不希望单词之间有句号或下划线。

test <- upset(grouped_hot,
sets= c("A Description", "B Description","C Description", "N Description"),
nintersects = 8, 
mb.ratio = c(0.6, 0.4),
sets.x.label = "Number of Patients",
sets.bar.color =  "#56B4E9", 
mainbar.y.label = "Number of Patients",
order.by = "freq", 
empty.intersections = "on", 
keep.order = FALSE,
 scale.sets = "identity", 
att.pos = "top", 
text.scale = c(2.5,2.5,2,1.5,2.5,2.5))

实际结果是我的图像集被标记为 A.Description、B.Description 和 C.Description。但是，我不想要单词之间的句点，而是想要一个空格。有什么想法只是为了情节的目的而更改设置名称标签的名称吗？谢谢!

Answer 1

我正在以略微不同的方式使用 upset 函数，但如果您能够重新格式化/重新排序您的输入数据，它可能会对您有所帮助。

这里:

##make input list
listInput = list(data.list1,
                 data.list2,
                 data.list3)
##rename list
names(listInput) = c("Name 1", "Name 2", "Name 3")

#make diagram
upset(fromList(listInput), order.by = "freq", #input, descending order  
      mainbar.y.label = "Number of common genes", #y axis
      sets.x.label = "Number of genes \nin the dataset", #x axis small plot
      main.bar.color = "black",
      sets.bar.color = "black",
      mainbar.y.max = 10 #y axis adjustment
        )

它将集合名称读取为名称 1、名称 2 和名称 3。

希望对您有所帮助:)安娜