从 geom_tile 中删除空行

Question

我有一个包含 5 列的数据框:

N1 <- an integer between c(125,100,80,70,60,50,40,30,20)

N2 <- an integer between c(1,5,10,15,20,25,30,35,40,50,60,80,100)

Type <- Two different types

Rang <- a number

crit <- a character, only one value

N1总是大于 N2 .
这是我的数据框( Rang_final )开头的示例:

N1  N2     Type      rang     crit
125   1 SST-T_2m  41.86395 BE_proba
125   1 T_2m-SST 163.41217 BE_proba
100   1 SST-T_2m  32.88181 BE_proba
100   1 T_2m-SST 137.44479 BE_proba
 80   1 SST-T_2m  22.57176 BE_proba
 80   1 T_2m-SST 112.52334 BE_proba
 70   1 SST-T_2m  21.30066 BE_proba
 70   1 T_2m-SST  99.65523 BE_proba
 60   1 SST-T_2m  18.48731 BE_proba
 60   1 T_2m-SST  85.36945 BE_proba
 50   1 SST-T_2m  18.60074 BE_proba
 50   1 T_2m-SST  71.58960 BE_proba
 40   1 SST-T_2m  18.58180 BE_proba
 40   1 T_2m-SST  62.82670 BE_proba
 30   1 SST-T_2m  20.53982 BE_proba
 30   1 T_2m-SST  48.58923 BE_proba
 20   1 SST-T_2m  27.15737 BE_proba
 20   1 T_2m-SST  36.04175 BE_proba
125   5 SST-T_2m 101.82300 BE_proba
125   5 T_2m-SST 168.69954 BE_proba
100   5 SST-T_2m  91.10644 BE_proba
...

我只想在一张图中包含所有这些信息，所以我正在寻找使用 ggplot 和 geom_tile像这样:

p <- ggplot(Rang_final)
p <- (p
      + geom_tile(data=Rang_final[Rang_final$Type=="SST-T_2m",], aes(x=N1, y=N2, fill=rang))
      + geom_tile(data=Rang_final[Rang_final$Type=="T_2m-SST",], aes(x=N2, y=N1, fill=rang))
      + scale_fill_gradient2(name="Rang", low="deepskyblue",mid="yellow",high="red", midpoint=100, na.value = "grey50")
      + theme(axis.title.x = element_text(size=14, face="bold"),
          axis.title.y = element_text(size=14, face="bold"),
          strip.text.x = element_text(size=14, face="bold"),
          strip.text.y = element_text(size=14, face="bold"),
          axis.text=element_text(size=14),
          axis.title.y=element_text(size=14, face="bold"),
          legend.key=element_rect(size=0.5, colour="black"),
          legend.text=element_text(size=10),
          legend.margin=unit(0,"lines"),
          legend.key.size=unit(0.8,"cm"),
          legend.text.align=0)
  + theme_bw()

)

print(p)

这就是我得到的(N1 和 N2 的类是数字):


但我想删除空行，所以我尝试将 N1 和 N2 转换为因子:

Rang_final$N1 <- factor(Rang_final$N1, levels = c("20", "30", "40", "50", "60", "70", "80", "100", "125") ,ordered = TRUE)
Rang_final$N2 <- factor(Rang_final$N2, levels = c("1", "5", "10", "15", "20", "25", "30", "35", "40", "50", "60", "80", "100", "125") ,ordered = TRUE)

但这里我的数字不是按递增顺序排列的。

在这里，我也使用 N1 和 N2 作为因子，但我无法在同一个图表上以这种比例显示两种不同的类型:

p <- ggplot(Rang_final, aes(x=N1, y=N2))
p <- (p
      + geom_tile(aes(fill=rang))
      + facet_grid(Type ~ crit, scales="free") 
      + scale_fill_gradient2(name="Rang", low="deepskyblue",mid="yellow",high="red", midpoint=100, na.value = "grey50")
      + theme(axis.title.x = element_text(size=14, face="bold"),
          axis.title.y = element_text(size=14, face="bold"),
          strip.text.x = element_text(size=14, face="bold"),
          strip.text.y = element_text(size=14, face="bold"),
          axis.text=element_text(size=14),
          axis.title.y=element_text(size=14, face="bold"),
          legend.key=element_rect(size=0.5, colour="black"),
          legend.text=element_text(size=10),
          legend.margin=unit(0,"lines"),
          legend.key.size=unit(0.8,"cm"),
          legend.text.align=0)
      + theme_bw()

)

有人能帮我吗？

Answer 1

这是我的建议。当您将 N1 和 N2 转换为因子时，您的 x 轴和 y 轴编号不按顺序排列的原因是您没有分配所需的顺序。这里我使用了 overflow包，因此您的数据框称为 mydf，与您发布的内容相同。我认为你需要做两件事。

1) 重新排序因子

您需要的是以正确的方式重新排列您的因子。当您在脚本中将字符转换为因子时，会发生类似的事情。

#> mydf$N1 <- as.factor(mydf$N1)
#> levels(mydf$N1)
#[1] "20"  "30"  "40"  "50"  "60"  "70"  "80"  "100" "125"
#> unclass(mydf$N1)
#[1] 9 9 8 8 7 7 6 6 5 5 4 4 3 3 2 2 1 1 9 9
#attr(,"levels")
#[1] "20"  "30"  "40"  "50"  "60"  "70"  "80"  "100" "125"

如果你看 unclass() ，您会看到“20”有 9。您希望“20”在 unclass() 中有 1 .因此，您希望对数据框进行排序。这导致了奇怪的数字顺序。在将字符转换为因子之前，您希望对 N1 和 N2 进行排序，并将它们转换为因子。

library(dplyr)
# Sort mydf by N1
mydf <- arrange(mydf, N1)

# Convert N1 to factor
mydf$N1 <- as.factor(mydf$N1)

在这里你看到“20”在 unclass 中有 1 个，而“125”有 9 个。所以这是你想要的顺序。

#> levels(mydf$N1)
#[1] "20"  "30"  "40"  "50"  "60"  "70"  "80"  "100" "125"
#> unclass(mydf$N1)
#[1] 1 1 2 2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8 8 9 9 9 9
#attr(,"levels")
#[1] "20"  "30"  "40"  "50"  "60"  "70"  "80"  "100" "125"

2) 数据子集

这可能/可能没有必要。但是，到目前为止，我认为这是必要的。以下似乎不太好。

  + geom_tile(data=Rang_final[Rang_final$Type=="SST-T_2m",], aes(x=N1, y=N2, fill=rang))
  + geom_tile(data=Rang_final[Rang_final$Type=="T_2m-SST",], aes(x=N2, y=N1, fill=rang))

所以，我做了一个技巧来安排你的数据。

 # Subset data using dplyr
 america <- filter(mydf, Type == "SST-T_2m")
 brazil <- filter(mydf, Type == "T_2m-SST")

 # Reverse N1 and N2 in brazil (So N1 is actually N2, and N2 is actually N1)
 colnames(brazil) <- c("N2","N1", "Type", "rang", "crit")
 brazil[,c(2,1,3:5)]

在对原始数据进行子集化并对巴西数据框进行处理后，我将它们组合起来。然后，我按照前面提到的方式安排因子顺序。

 canada <- rbind(america, brazil)
 canada <- arrange(canada,N1)
 canada$N1 <- as.factor(canada$N1)

 canada <- arrange(canada,N2)
 canada$N2 <- as.factor(canada$N2)

现在我画一个图。我不知何故对传说相关的事情有问题。所以我在这里删除了它们。

x <- ggplot(canada)
x <- (x
  + geom_tile(aes(x=N1, y=N2, fill =rang))
  + scale_fill_gradient2(name="Rang", low="deepskyblue",mid="yellow",high="red",     midpoint=100, na.value = "grey50")
  + theme(axis.title.x = element_text(size=14, face="bold"),
      axis.title.y = element_text(size=14, face="bold"),
      strip.text.x = element_text(size=14, face="bold"),
      strip.text.y = element_text(size=14, face="bold"),
      axis.text=element_text(size=14),
      axis.title.y=element_text(size=14, face="bold"))
  + theme_bw()

 )

让我知道这是否适合您。