在后台并行 session 中运行 R 脚本

Question

我有一个脚本 test.R，它接受参数 arg1、arg2 并输出一个 arg1-arg2.csv文件。

我想在 6 个并行 session (我在 6 核 CPU 上)和后台运行 test.R。我该怎么做？

我在 linux 上

Answer 1

我建议使用 doParallel foreach 的后端包裹。 foreach 包提供了一个很好的语法来编写循环并负责组合结果。 doParallel 将其连接到 parallel自 R 2.14 起包含包。在其他设置(旧版本的 R、集群等)上，您可以简单地更改后端，而无需触及任何 foreach 循环。特别是 foreach 包有很好的文档，所以它真的很容易使用。

如果您要将结果写入单独的文件，那么 foreach 的结果组合功能对您来说用处不大。所以人们可能会争辩说直接使用并行会更适合您的应用程序。就我个人而言，我发现 foreach 表达循环概念的方式更易于使用。