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我有以下问题:
我使用 deepchem 创建了一个模型,这是一个包装好的 keras 模型,对其进行了训练并重新加载了它。我可以毫无问题地预测使用这个模型。
现在我想制作这个模型的副本,它少了一个输入,因为在我的使用场景中一个输入总是不变的,并且总是传递它会导致我无法编辑的函数中的错误。
data = np.array(data.data, dtype=float32)
with tf.Graph().as_default() as temp_graph:
tf.import_graph_def(self.model.session.graph.as_graph_def(),
input_map={self.model._input_placeholders[1].name:
tf.constant(np.array([0], dtype=float32)),})
#self.model.session.graph = temp_graph
#for deep explainer: replace all switched dropouts with dropouts
#get input tensor for this graph
tensors = tf.contrib.graph_editor.get_tensors(temp_graph)
for t in tensors:
if "input_1" in t.name:
input_tensor = t
break
#reshape output --> only singletask!
output = tf.reshape(tensors[-1], [-1, 1])
model = (input_tensor, output)
sess = tf.Session(graph=temp_graph)
feed_dict = dict(zip([input_tensor], [data]))
print(sess.run(output, feed_dict))
在这段代码片段中,我能够加载模型的图形并将常量传递到其输入中。现在显然我不能在同一个 session 中运行这个新模型,因为那个 session 包含旧模型。无法更改使用 feed dict 运行模型的方式,因为它在实际场景中位于另一个包中。我收到以下错误消息:
Error while reading resource variable dense_2/bias from Container: localhost. This could mean that the variable was uninitialized. Not found: Container localhost does not exist.
完整的跟踪是:
Traceback (most recent call last):
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 1356, in _do_call
return fn(*args)
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 1341, in _run_fn
options, feed_dict, fetch_list, target_list, run_metadata)
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 1429, in _call_tf_sessionrun
run_metadata)
tensorflow.python.framework.errors_impl.FailedPreconditionError: Error while reading resource variable dense_2/bias from Container: localhost. This could mean that the variable was uninitialized. Not found: Container localhost does not exist. (Could not find resource: localhost/dense_2/bias)
[[{{node import/model/dense_2/BiasAdd/ReadVariableOp}}]]
During handling of the above exception, another exception occurred:
Traceback (most recent call last):
File "/EXT/Tobha/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/Models.py", line 490, in <module>
main()
File "/EXT/Tobha/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/Models.py", line 478, in main
evaluate()
File "/EXT/Tobha/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/Models.py", line 445, in evaluate
reader.explain()
File "/EXT/Tobha/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py", line 1534, in explain
self.explain()
File "/EXT/Tobha/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py", line 1519, in explain
self._explain_Gradient_SHAP(self.df)
File "/EXT/Tobha/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py", line 2047, in _explain_Gradient_SHAP
print(sess.run(output, feed_dict))
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 950, in run
run_metadata_ptr)
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 1173, in _run
feed_dict_tensor, options, run_metadata)
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 1350, in _do_run
run_metadata)
File "/EXT/Tobha/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/client/session.py", line 1370, in _do_call
raise type(e)(node_def, op, message)
tensorflow.python.framework.errors_impl.FailedPreconditionError: Error while reading resource variable dense_2/bias from Container: localhost. This could mean that the variable was uninitialized. Not found: Container localhost does not exist. (Could not find resource: localhost/dense_2/bias)
[[node import/model/dense_2/BiasAdd/ReadVariableOp (defined at /eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py:2033) ]]
Original stack trace for 'import/model/dense_2/BiasAdd/ReadVariableOp':
File "/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/Models.py", line 490, in <module>
main()
File "/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/Models.py", line 478, in main
evaluate()
File "/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/Models.py", line 445, in evaluate
reader.explain()
File "/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py", line 1534, in explain
self.explain()
File "/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py", line 1519, in explain
self._explain_Gradient_SHAP(self.df)
File "/eclipse-workspace/Bachelorarbeit/toolbox_dc_2_3_0/python_source/DataHandling.py", line 2033, in _explain_Gradient_SHAP
tf.constant(np.array([0], dtype=float32)),})
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/util/deprecation.py", line 507, in new_func
return func(*args, **kwargs)
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/framework/importer.py", line 443, in import_graph_def
_ProcessNewOps(graph)
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/framework/importer.py", line 236, in _ProcessNewOps
for new_op in graph._add_new_tf_operations(compute_devices=False): # pylint: disable=protected-access
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/framework/ops.py", line 3751, in _add_new_tf_operations
for c_op in c_api_util.new_tf_operations(self)
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/framework/ops.py", line 3751, in <listcomp>
for c_op in c_api_util.new_tf_operations(self)
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/framework/ops.py", line 3641, in _create_op_from_tf_operation
ret = Operation(c_op, self)
File "/.conda/envs/test_BA_Tobias_std_deepchem-2-3-0_py36_20200114/lib/python3.6/site-packages/tensorflow/python/framework/ops.py", line 2005, in __init__
self._traceback = tf_stack.extract_stack()
我正在使用 tensorflow 1.14 和 Python 3.6(这也不能改变)
最佳答案
这个错误有点棘手。以下是一些浮现在脑海中的建议:
关于python - 使 tensorflow 模型中的一个输入保持不变,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/60615290/
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