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我正在尝试使用名为 dendextend 的出色 R 包来绘制树状图并根据一组先前定义的组为其分支和标签着色。
我已经阅读了 Stack Overflow 中的答案以及 dendextend 小插图的常见问题解答,但我仍然不确定如何实现我的目标。
假设我有一个数据框,其中第一列包含用于聚类的个人姓名,然后是几列包含要分析的因素,最后一列包含每个人的组信息(见下表) .
individual 282856 282960 283275 283503 283572 283614 284015 group
pat15612 0 0 0 0 0 0 0 g2
pat38736 0 0 0 0 0 0 0 g2
pat38740 0 0 0 0 0 1 0 g2
pat38742 0 0 0 0 0 1 0 g4
pat38743 0 0 1 0 0 1 0 g3
pat38745 0 0 1 0 1 0 0 g4
pat38750 0 0 0 1 0 1 0 g4
pat38753 0 0 0 1 0 0 0 g3
pat40120 0 0 0 0 1 0 0 g4
pat40124 0 0 0 0 1 0 0 g4
pat40125 0 0 0 0 1 1 0 g4
pat40126 0 0 0 1 0 0 0 g4
pat40137 1 0 0 0 0 0 0 g4
pat40142 0 1 0 0 0 0 0 g5
pat46903 0 0 0 0 0 1 0 g1
pat67612 1 0 0 0 1 0 0 g1
pat67621 0 0 0 0 0 0 0 g2
pat67630 0 0 1 0 0 0 0 g2
pat67634 0 0 0 0 0 0 0 g5
pat67657 0 1 0 1 0 0 0 g5
pat67680 0 0 0 0 0 1 0 g5
pat67683 0 0 1 1 0 0 0 g6
最佳答案
我很高兴你自己解决了这个问题。
更简单的解决方案是使用 order_value = TRUE
set
中的参数功能。例如:
library(dendextend)
iris2 <- iris[,-5]
rownames(iris2) <- paste(iris[,5],iris[,5],iris[,5], rownames(iris2))
dend <- iris2 %>% dist %>% hclust %>% as.dendrogram
dend <- dend %>% set("labels_colors", as.numeric(iris[,5]), order_value = TRUE) %>%
set("labels_cex", .5)
par(mar = c(4,1,0,8))
plot(dend, horiz = T)
关于r - Dendextend:关于如何根据定义的组为树状图的标签着色,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/45217384/
我正在尝试使用名为 dendextend 的出色 R 包来绘制树状图并根据一组先前定义的组为其分支和标签着色。 我已经阅读了 Stack Overflow 中的答案以及 dendextend 小插图的
我了解如何将彩色条添加到 dendextend 图,但是当我设置 horiz=T 时,条绘制在错误的轴上。 dendextend 简介中的示例展示了如何向图中添加彩色条: dend15 % dist
我是一名优秀的程序员,十分优秀!