r - 如何在 "R"中的foreach循环中导出多个函数或包

Question

我试图通过使用R中的doParallel包来减少代码的运行时间。

我正在调用函数awareRateSIR，该函数的主体中使用了一些额外的包。我收到一些错误，例如

could not find function "vcount" and..

我知道 vcount是 igraph中使用的 awareRateSIR包的功能)，但它不是唯一的。我怎么解决这个问题？我以为我应该传递函数 awareRateSIR中使用的所有软件包名称，但是我不知道如何无法在 foreach中导出多个函数或如何导出多个软件包名称。

这是我的代码:

tp<-foreach(i=1:iter,  .inorder = FALSE, .export = "awareRateSIR",
          .packages = "igraph", .packages="doParallel")%dopar%{
tp <- awareRateSIR(graphContact, graphCom,state)
return(tp)
}

如果我不通过这些程序包，我将得到错误状态，如果我通过所有程序包，则将出现某些功能未知的错误:

Error in foreach(i = 1:iter, .inorder = FALSE, .export = "awareRateSIR", : formal argument ".packages" matched by multiple actual arguments"

提前致谢

Answer 1

您应该使用c函数传递所需的所有软件包，如下所示:

tp<-foreach(i=1:iter,  .inorder = FALSE, .export = "awareRateSIR",
          .packages = c("igraph", "doParallel"))%dopar%{
tp <- awareRateSIR(graphContact, graphCom,state)
return(tp)
}