r - 没有使用 RMySQL 选择数据库

Question

我正在尝试连接到远程可公开访问的 MySQL 服务器 EnsEMBL公共(public)服务器使用 RMySQL ，但是当我尝试列出表时，会发生错误:

library(RMySQL)

mydb = dbConnect(MySQL(), 
                 user = 'anonymous',
                 port = 5306,
                 host = 'asiadb.ensembl.org')

dbListTables(mydb)

Error in .local(conn, statement, ...) : 
  could not run statement: No database selected

有没有办法查到名字？还是我完全犯了一个完全不同的错误？

Answer 1

您必须在 dbConnect 调用中指定数据库的名称。例如:

mydb = dbConnect(MySQL(), 
                 user = 'anonymous',
                 port = 5306,
                 host = 'asiadb.ensembl.org',
                 db = 'homo_sapiens_core_83_38')

dbListTables(mydb)