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我有一个正在创建的 r 代码,我想检测 Windows 中正在运行的 R 实例的数量,以便脚本可以选择是否运行一组特定的脚本(即,如果已经有 >2 个 R 实例运行做X,否则Y)。
有没有办法在 R 中做到这一点?
编辑:
以下是有关目的的一些信息:
我有很长的脚本集,用于使用 catnet 库为数千个案例应用贝叶斯网络模型。此代码处理并将结果输出到每个案例的 csv 文件中。我尝试过的大多数并行计算替代方案并不理想,因为它们抑制了很多内置的进度通知,因此我一直在不同的 R 实例上运行案例的子集。我知道这有点过时,但它对我有用,所以我想要一种方法,让代码子集根据运行的实例数量自动确定案例数量。
我现在通过在 CMD 中打开多个 Rscript 实例来手动执行此操作,打开配置略有不同的 r 文件以获得如下内容:
cd "Y:\code\BN_code"
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "process spp data3.r" /b
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "process spp data3_T1.r" /b
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "process spp data3_T2.r" /b
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "process spp data3_T3.r" /b
编辑2:
#the cases that I need to apply my code to:
splist=c("sp01", "sp02", "sp03", "sp04", "sp05", "sp06", "sp07", "sp08", "sp09", "sp010", "sp11", "sp12",
"sp013", "sp014", "sp015", "sp16", "sp17", "sp018", "sp19", "sp20", "sp21", "sp22", "sp23", "sp24")
###automatic subsetting of cases based on number of running instances of r script:
cpucores=as.integer(Sys.getenv('NUMBER_OF_PROCESSORS'))
n_instances=length(system('tasklist /FI "IMAGENAME eq Rscript.exe" ', intern = TRUE))-3
jnk=length(system('tasklist /FI "IMAGENAME eq rstudio.exe" ', intern = TRUE))-3
if (jnk>0)rstudiorun=TRUE else rstudiorun=FALSE
if (!rstudiorun & n_instances>0 & cpucores>1){ #if code is being run from rscript and
#not from rstudio and there is more than one core available
jnkn=length(splist)
jnk=seq(1,jnkn,round(jnkn/cpucores,0))
jnk=c(jnk,jnkn)
splist=splist[jnk[n_instances]:jnk[n_instances+1]]
}
###end automatic subsetting of cases
#perform your script on subset of list of cases:
for(sp in splist){
ptm0 <- proc.time()
Sys.sleep(6)
ptm1=proc.time() - ptm0
jnk=as.numeric(ptm1[3])
cat('\n','It took ', jnk, "seconds to do species", sp)
}
要使此代码在 Windows 中自动在 r 的多个实例上运行,只需创建一个 .bat 文件:
cd "C:\Users\lfortini\code\misc code\misc r code"
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "rscript_multiple_instances.r" /b
timeout 10
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "rscript_multiple_instances.r" /b
timeout 10
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "rscript_multiple_instances.r" /b
timeout 10
START "" "C:\Program Files\R\R-3.0.0\bin\x64\Rscript.exe" "rscript_multiple_instances.r" /b
exit
超时是为了给 r 足够的时间来检测它自己的实例数。
最佳答案
其实比想象的要容易,因为Windows自带了不错的功能tasklist
找到 here .
有了它,您可以获得所有正在运行的进程,您只需计算 Rscript.exe
的数量即可。实例(我在这里使用 stringr
进行字符串操作)。
require(stringr)
progs <- system("tasklist", intern = TRUE)
progs <- vapply(str_split(progs, "[[:space:]]"), "[[", "", i = 1)
sum(progs == "Rscript.exe")
Rgui.exe
的实例,但效果很好。)
关于r - 检测r内windows中正在运行的r个实例的数量,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/15935931/
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