r - 如何将多个目录中的多个文件读入R进行处理？

Question

我正在运行模拟研究，需要处理和保存几个文本文件中的结果。我以这样一种方式来组织数据，即在每个子目录中都有子目录，我需要处理并获取1000个数据文件的单独结果。在SAS中使用宏非常容易做到这一点。但是，我是R的新手，无法弄清楚该怎么做。以下是我要完成的工作。

DATA Folder-> DC1 -> DC1R1.txt ... DC1R1000.txt
              DC2 -> DC2R1.txt ... DC2R1000.txt

任何帮助将不胜感激!

Answer 1

我现在不在带R的计算机附近，但请阅读文件相关功能的帮助:
dir函数将列出文件和目录。它具有递归参数。list.files是dir的别名。 file.info函数将(除其他事项外)告诉您路径是否为目录，并且file.path将组合路径部分。
basename和dirname函数也可能有用。

请注意，所有这些功能都是矢量化的。

编辑现在在计算机上，所以有一个例子:

# Make a function to process each file
processFile <- function(f) {
  df <- read.csv(f)
  # ...and do stuff...
  file.info(f)$size # dummy result
}

# Find all .csv files
files <- dir("/foo/bar/", recursive=TRUE, full.names=TRUE, pattern="\\.csv$")

# Apply the function to all files.
result <- sapply(files, processFile)