r - 有没有办法让 "findpeaks"函数在大型数据集上运行得更快？

Question

我有一个名为“endata”的大型数据集 - 590 万个数据点。这表示超过 90 天的数据。数据集是单个向量。前五个数据点如下所示:

0.0171365458527622 0.0174577280551263 0.0177808003184100 0.0181056613918160 0.0184322165779018 0.0187603772480992

我想使用 pracma 包中的“findpeaks”功能。这是我想使用的一行代码:

y <- data.frame(findpeaks(-endata,minpeakdistance=10, nups=1, ndowns=1, npeaks=Inf, minpeakheight = -0.5, sortstr=FALSE))

该函数需要很长时间(小时)才能运行。有什么办法可以让函数运行得更快？我已经尝试过按天拆分数据集，但这使得输出难以管理。

Answer 1

您可以在 R 中使用并行计算来加快速度。变化 cores=以适合您的机器。

library(doMC)
registerDoMC(cores = 5)

y <- data.frame(findpeaks(-endata,minpeakdistance=10, nups=1, ndowns=1, 
                npeaks=Inf, minpeakheight = -0.5, sortstr=FALSE))

registerDoSeq()