R 图 : Scaling node size

Question

我目前使用以下脚本来创建介数中心性图:

plot(g, 
     rescale = FALSE,
     edge.color= edge_color,
     edge.width=E(g)$Weight*0.5,
     vertex.size= degree(g)*0.5,
     main="Degree Centrality"
)

如您所见，我目前使用一个简单的乘数来调整 vertex.size。由于有些节点非常大，有些节点看起来太小，我想设置一个最小和最大尺寸的范围。当然，这个范围要考虑degree(g)。

这有可能吗？

注意:尝试使用 scale (degree(g), 5, 15) 或类似方法无效:“符号错误 (x = coords[, 1], y = coords[, 2 ], bg = vertex.color, : 无效的符号参数"

Answer 1

要将域为 (a,b) 的数字 x 重新缩放到 (c,d) 的范围，您需要创建一个重新缩放函数，例如:

rescale = function(x,a,b,c,d){c + (x-a)/(b-a)*(d-c)}

因此，如果您的度大小为 0 到 200，并且希望顶点大小的范围为 1 到 5 个单位，请指定顶点大小:

rescale(degree(g), 0, 200, 1, 5)

这只是一个简单的线性变换 - 您可能需要一些非线性的东西以获得更好的视觉效果。

您可能会在某处的包中找到 rescale 函数(例如 scales 包中的 rescale 函数)，但它不是什么 scale 可以!