r - 如何在R中删除具有特定模式形式数据框的字符

Question

我试图从我的 data.frame 的最后一列中删除所有以模式“Gm”开头的字符

我的 data.frame 看起来像这样

level   logp  chr   start    end     CNA      Genes                                                           
  3     1.4   3      100     110    gain     Gm5852,Gm5773,Tdpoz4,Tdpoz3,Gm911                      
  4     18.10 3      962      966   gain     Fcgr1,Terc,Gm5703      

结果应该是这样的

level   logp     chr   start    end     CNA           Genes                                                           
   3     1.4      3      100     110    gain    Tdpoz4,Tdpoz3                   
   4     18.10    3      962     966    gain    Fcgr1,Terc   

Answer 1

这使用单个 gsub 来删除不需要的部分:

Genes <- c("Gm5852,Gm5773,Tdpoz4,Tdpoz3,Gm911", "Fcgr1,Terc,Gm5703") # test data
gsub(",?Gm[^,]*,?", "", Genes)

给予:

[1] "Tdpoz4,Tdpoz3" "Fcgr1,Terc"

这是正则表达式的可视化:

,?Gm[^,]*,?

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