r - R : How can I get deterministic results from pvclust? 中的聚类分析

Question

pvclust 非常适合在 R 中进行聚类分析。但是，当它作为批处理操作的一部分运行时，对于相同的数据得到不同的结果是很烦人的。显然，同一数据有许多“正确”的聚类，似乎 pvclust 使用了一些随机性来确定特定运行的聚类。但是有什么方法可以得到确定性的结果吗？

我希望能够展示一个最小的、可重复的分析包:数据加上一个 R 脚本，以及一个单独的书面文档，其中包含我对聚类的解释。然后其他人可以添加到分析中，例如通过改变情节的美学外观。现在，解释总是与其他人在运行包含 pvclust 的脚本时得到的不同步。

Answer 1

不仅用于聚类分析，当涉及随机性时，您可以修复随机数生成器，以便始终获得相同的结果。

试试:

set.seed(seed=123)
# your code here

seed 可以是任何整数，或者可以转换为整数的东西。仅此而已。