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如何在 ggplot 的 geom_net
库中标记边?
library(geomnet)
library(ggplot2)
x <- structure(list(from = c("a", "b", "d", "f", "g", "e", "c", "i",
"e", "h", "i", "i", "j", "j"), to = c("", "", "", "", "", "a",
"b", "c", "d", "e", "f", "g", "h", "i"), edge_val = c(NA, NA,
NA, NA, NA, 1.6, 2.25, 1.75, 0.95, 1.8, 3.2, 2.6, 2.95, 2.45)), .Names = c("from",
"to", "edge_val"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -14L
))
ggplot(x, aes(from_id = from, to_id = to, linewidth = edge_val)) +
geom_net(layout.alg = "fruchtermanreingold", labelgeom = "text",repel = TRUE,
size = 4, labelon = TRUE, vjust = -1, ecolour = "grey80",
directed = FALSE, fontsize = 4, ealpha = 0.5) +
theme_net()
最佳答案
我对用于 geom_net()
的代码进行了一些修改(找到 here )。可以这样使用:
# similar code as question, with linelabel = edge_val added to aes() & geom_net2
ggplot(x,
aes(from_id = from, to_id = to, linewidth = edge_val, linelabel = edge_val)) +
geom_net2(layout.alg = "fruchtermanreingold", labelgeom = "text", repel = TRUE,
size = 4, labelon = TRUE, vjust = -1, ecolour = "grey80",
directed = FALSE, fontsize = 4, ealpha = 0.5) +
theme_net()
创建 geom_net2()
:
第 1 步:创建 geomnet::GeomNet
使用的 draw_panel
函数的修改版本,如果 aes,则使用线标签(...)
包括 linelabel
的映射。
old.draw_panel <- environment(GeomNet$draw_panel)$f
new.draw_panel <- old.draw_panel
# convert function body to a list, for easier code chunk insertions
body(new.draw_panel) <- as.list(body(new.draw_panel))
# geomnet code includes usage of %||%, which is an unexported function
# (it is identical to the exported version in rlang / purrr, so you can skip
# this step if you have one of those packages loaded)
body(new.draw_panel) <-
append(body(new.draw_panel),
substitute(
"%||%" <- function(a, b) {if (!is.null(a)) a else b}
), after = 1)
# remove the last chunk of code, which returns a grobTree for the geom layer
# (we'll add on a new grobTree later)
body(new.draw_panel) <-
body(new.draw_panel)[-length(body(new.draw_panel))]
# define label_line as NULL
body(new.draw_panel) <-
append(body(new.draw_panel),
substitute(
label_line <- NULL
))
# if aes(...) includes a mapping for linelabel, use it for label_line, positioned at the
# midpoint of each line
body(new.draw_panel) <-
append(body(new.draw_panel),
substitute(
if (!is.null(data$linelabel)){
label_line.df <- subset(data, to != "")
label_line.df$x <- (label_line.df$x + label_line.df$xend) / 2
label_line.df$y <- (label_line.df$y + label_line.df$yend) / 2
label_line.df$label <- label_line.df$linelabel
label_line <- ggplot2::GeomText$draw_panel(label_line.df,
panel_scales, coord)
}
))
# return a grobTree, with label_line added
body(new.draw_panel) <-
append(body(new.draw_panel),
substitute(
ggplot2:::ggname("geom_net2",
grid::grobTree(edges_draw, selfies_draw, selfies_arrows,
GeomPoint$draw_panel(vertices, panel_scales, coord),
label_grob, label_line))
))
body(new.draw_panel) <- as.call(body(new.draw_panel))
rm(old.draw_panel)
第2步:创建GeomNet2
ggproto,它继承自geomnet::GeomNet
,但使用修改后的draw_panel
功能。
GeomNet2 <- ggproto(`_class` = "GeomNet2",
`_inherit` = geomnet::GeomNet,
draw_panel = new.draw_panel)
第三步:创建geom_net2
函数,与geomnet::geom_net
类似,只是使用了GeomNet2
作为它的 geom。
geom_net2 <- function (
mapping = NULL, data = NULL, stat = "net", position = "identity", show.legend = NA,
na.rm = FALSE, inherit.aes = TRUE, layout.alg="kamadakawai", layout.par=list(),
directed = FALSE, fiteach=FALSE, selfloops = FALSE, singletons = TRUE, alpha = 0.25,
ecolour=NULL, ealpha=NULL, arrow=NULL, arrowgap=0.01, arrowsize=1, labelon=FALSE,
labelcolour=NULL, labelgeom = 'text', repel = FALSE,
vertices=NULL, ...) {
ggplot2::layer(
geom = GeomNet2, mapping = mapping, data = data, stat = stat,
position = position, show.legend = show.legend, inherit.aes = inherit.aes,
params = list(na.rm = na.rm, layout.alg=layout.alg, layout.par=layout.par,
fiteach=fiteach, labelon=labelon, labelgeom=labelgeom, ecolour = ecolour,
ealpha=ealpha, arrow=arrow, arrowgap=arrowgap, directed=directed, repel=repel,
arrowsize=arrowsize, singletons=singletons, labelcolour=labelcolour,
vertices=vertices, selfloops = selfloops,
...)
)
}
关于r - r 中 geom_net 中的标签边,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/52356514/
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