r - 在 Markdown 文件上使用 knit 但忽略一大块代码 - 采购 knitr 文件

Question

这类似于 How to source R Markdown file like `source('myfile.r')`?有以下区别:我希望我的 Markdown 文件生成一个 R 脚本以供将来采购。上一个问题对直接获取 Markdown 文件感兴趣(此时似乎并不容易)。

通过包含以下内容，可以编译生成可用源 R 文件的 .Rmd Markdown 文件:

```{r, ignore = TRUE, include = FALSE}
knit('markdown_file.Rmd', 'source_file.R', tangle = T)
```

这将创建一个 source_file.R 非常好，但它包含 knit最后调用。所以当我 source("source_file.R)在不同的脚本中，它重新创建并覆盖自己，这似乎是不好的做法。有没有办法告诉 knit忽略.Rmd 文件中的一段代码？

Answer 1

我使用 bash 脚本解决了这个问题，并从 R 脚本中完全删除了那个编织片段。

Rscript -e 'knitr::knit("markdown_file.Rmd", "source_file.R", tangle = T)'

因此，通过这种方法，我可以使用类似的 bash 脚本将我的 .Rmd 编​​织到所需的文档输出中(如 pdf，代码未显示)，然后这行代码创建一个 R 文件，该文件可以被其他 R 脚本使用.实际上，我不再需要调用 knit在 Rmd 文件中(或在 RStudio 中)。