r - 如何使 grepl 功能具体化？

Question

我的数据框如下所示。我需要根据“geneID”列的名称一一提取特定行的数据。我使用 grepl 函数。

#Data frame:geneDf  
geneID=c("EGFR","Her2","PTENPP","PTEN")
patient1=c(12,23,56,23)
patient2=c(23,34,11,6)
patient3=c(56,44,32,45)
patient4=c(23,64,45,23)
geneDf=data.frame(patient1,patient2,patient3,patient4,geneID)

geneDf
  patient1 patient2 patient3 patient4 geneID
1       12       23       56       23   EGFR
2       23       34       44       64   Her2
3       56       11       32       45 PTENPP
4       23        6       45       23   PTEN

前三行运行良好。

targetGene<-subset(geneDf,grepl(geneDf$geneID[1],geneDf$geneID))
targetGene
  patient1 patient2 patient3 patient4 geneID
1       12       23       56       23   EGFR

当我提取第 4 行的数据时，我得到了这个:

targetGene<-subset(geneDf,grepl(geneDf$geneID[4],geneDf$geneID))
targetGene
  patient1 patient2 patient3 patient4 geneID
3       56       11       32       45 PTENPP
4       23        6       45       23   PTEN

似乎其他数据，在这种情况下，“geneID”列的第3行，包括第4行的内容也被拾取。我的命令有什么问题？如何让它每次只取某一行的数据？

Answer 1

您可能需要 字边界 即 \\b 或使用

subset(geneDf, grepl(paste0('^', geneID[4], '$'), geneID))
#  patient1 patient2 patient3 patient4 geneID
#4       23        6       45       23   PTEN

或者

subset(geneDf, grepl(paste0('\\b', geneID[4], '\\b'), geneID))
#   patient1 patient2 patient3 patient4 geneID
#4       23        6       45       23   PTEN