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data(airquality)
library(quantreg)
library(ggplot2)
library(data.table)
library(devtools)
# source Quantile LOESS
source("https://www.r-statistics.com/wp-content/uploads/2010/04/Quantile.loess_.r.txt")
airquality2 <- na.omit(airquality[ , c(1, 4)])
#'' quantreg::rq
rq_fit <- rq(Ozone ~ Temp, 0.95, airquality2)
rq_fit_df <- data.table(t(coef(rq_fit)))
names(rq_fit_df) <- c("intercept", "slope")
#'' quantreg::lprq
lprq_fit <- lapply(1:3, function(bw){
fit <- lprq(airquality2$Temp, airquality2$Ozone, h = bw, tau = 0.95)
return(data.table(x = fit$xx, y = fit$fv, bw = paste0("bw=", bw), fit = "quantreg::lprq"))
})
#'' Quantile LOESS
ql_fit <- Quantile.loess(airquality2$Ozone, jitter(airquality2$Temp), window.size = 10,
the.quant = .95, window.alignment = c("center"))
ql_fit_df <- data.table(x = ql_fit$x, y = ql_fit$y.loess, bw = "bw=1", fit = "Quantile LOESS")
我想把所有这些都放在一个情节中。
最佳答案
geom_quantile
可以在内部使用rq
方法计算分位数,因此我们不需要单独创建rq_fit_df
。但是,lprq
和 Quantile LOESS
方法在 geom_quantile
中不可用,因此我使用了您提供的数据框并使用几何线
。
此外,为了在颜色和线型映射以及图例中包含 rq
线,我们添加了 aes(colour="rq", linetype="rq")
作为 geom_quantile
中的一种“人工”映射。
library(dplyr) # For bind_rows()
ggplot(airquality2, aes(Temp, Ozone)) +
geom_point() +
geom_quantile(quantiles=0.95, formula=y ~ x, aes(colour="rq", linetype="rq")) +
geom_line(data=bind_rows(lprq_fit, ql_fit_df),
aes(x, y, colour=paste0(gsub("q.*:","",fit),": ", bw),
linetype=paste0(gsub("q.*:","",fit),": ", bw))) +
theme_bw() +
scale_linetype_manual(values=c(2,4,5,1,1)) +
labs(colour="Method", linetype="Method",
title="Different methods of estimating the 95th percentile by quantile regression")
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