r - 字符向量作为 R 脚本的参数

Question

我正在运行 R 脚本，但遇到错误:

Rscript 示例.R "a,b,c"

我在上面的代码中运行，其中 a、b、c 是作为参数传递的字符向量的元素。如果我传递数值(例如 1、5、6)，上面的代码工作正常

Code is :
library("optparse")
library("tldutils") # eval_string
# install.packages("tldutils", repos="http://R-Forge.R-project.org")
option_list <- list(
make_option(c("-c", "--count"), type="character", default="5",
help='Vector of numbers separated by commas and surrounded by ""',
metavar="number")
)
args <- parse_args(OptionParser(option_list = option_list))
print(args$c)
eval_string(sprintf("foo = c(%s)", args$c))
print(foo)

错误是:

Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'a' not found
Calls: eval_string -> eval.parent -> eval -> eval
Execution halted

请帮助我，我需要在代码中编辑什么地方？

Answer 1

不确定我是否能准确了解您的需求，但我希望您能够自己弄清楚细节并解决您的问题。

将字符向量作为参数传递给 R 的最简单方法是使用 commandArgs 函数(基本包的函数，无需安装任何花哨的东西)。

# Start R from the shell
$ R --args a,b,c

# Within R
> commandArgs()
[1] "/usr/lib64/R/bin/exec/R" "--args"                 
[3] "a,b,c"

如果您只想获取 --args 之后指定的参数，请使用 trailingOnly=TRUE。添加 strsplit 将 "a,b,c" 转换为三元素向量。或者，将逗号更改为空格，并且您不需要 strsplit。

$ R --args a,b,c
...
> strsplit(commandArgs(TRUE), ",")[[1]]
[1] "a" "b" "c"

$ R --args a b c
...
> commandArgs(T)
[1] "a" "b" "c"