r - 如何在 R 中计算相关性

Question

我想计算 R 中数据集 x 的子集的列之间的相关系数我有 40 行模型，每行 200 次模拟，总共 8000 行我想计算每次模拟的列之间的校正系数(40 行)

cor(x[c(3,5)]) 从所有 8000 行计算
我需要 cor(x[c(3,5)]) 但只有当 X$nsimul=1 等等

你能在这方面帮助我吗桑

Answer 1

我不确定你到底在用 x[c(3,5)] 做什么，但看起来你想做如下的事情:你有一个数据框X 像这样:

set.seed(123)
X <- data.frame(nsimul = rep(1:2, each=5), a = sample(1:10), b = sample(1:10))

> X
   nsimul  a  b
1       1  1  6
2       1  8  2
3       1  9  1
4       1 10  4
5       1  3  9
6       2  4  8
7       2  6  5
8       2  7  7
9       2  2 10
10      2  5  3

并且您想将此数据框按 nsimul 列拆分，并计算每个组中 a 和 b 之间的相关性。这是一个经典的split-apply-combine 问题，plyr 包非常适合解决这个问题:

require(plyr)
> ddply(X, .(nsimul), summarize, cor_a_b = cor(a,b))
  nsimul    cor_a_b
1      1 -0.7549232
2      2 -0.5964848