r - 使用R，如何在不打开文件的情况下查找文件中特定短语的行号？

Question

我是 R 新手。我有一个包含两列的大 (3.2 Gb) txt 文件。第一列具有人类基因组序列位置，第二列具有对应于每个位置的值。我想从第一列中找到特定位置的行号，然后将这些行读入 R 中的表中。由于内存问题，我无法导入文件。这是我试图从数据文件的第一列中获取一个特定位置的行号的 R 代码示例。数据文件称为 my.data。

con <- file("my.data",open="r");
grep("13108", con)

grep 不起作用。

如果有人能告诉我正确的代码，我将不胜感激。

Answer 1

尝试一些类似的东西:

read.csv(pipe("grep 13108 my.data"), ...)

(为您的数据适当填写参数)