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我有一个生殖对的边缘列表如下: male_ID=c(1,2,3,4,5), female_ID=c(6,7,8,9,10), a=cbind(male_ID, female_ID)
使用 Igraph 我从数据中生成了一个图表,对完整的 df 进行绘制和运行一些分析: g <- graph_from_data_frame(a)
我的问题是,我现在可以根据它们在边缘列表中列出的列,为个体的性别添加一个属性(给顶点着色)吗?
最佳答案
您可以为图形对象分配组标签。
为了创建组向量“性别”,您的数据框表明您的男性和女性一样多。 graph_from_data_frame()
将mal_ID 和female_ID 列堆叠在一起,您可以使用igraph::V(g)
进行检查。 .因此,您可以从该信息中导出组向量:
male_ID=c(1,2,3,4,5); female_ID=c(6,7,8,9,10); a=cbind(male_ID, female_ID)
#create graph object from dataframe
g <- igraph::graph_from_data_frame(a)
#investigate structure g
igraph::V(g)
#[1] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
# create sex group vector
sex <- c(replicate(length(male_ID), "Male"), replicate(length(female_ID), "Female"))
#Check group values
print(igraph::V(g)$group)
# NULL
#assign groups
igraph::V(g)$group <- sex
#Check group values again
print(igraph::V(g)$group)
#[1] "Male" "Male" "Male" "Male" "Male" "Female" "Female" "Female" "Female" "Female"
# I use visnetwork to visualise
vis_g <- visNetwork::toVisNetworkData(g, idToLabel = TRUE)
visNetwork::visNetwork(
nodes = vis_g$nodes,
edges = vis_g$edges
)
关于r - 将属性(性别)添加到边列表中的顶点,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/63596618/
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