- html - 出于某种原因,IE8 对我的 Sass 文件中继承的 html5 CSS 不友好?
- JMeter 在响应断言中使用 span 标签的问题
- html - 在 :hover and :active? 上具有不同效果的 CSS 动画
- html - 相对于居中的 html 内容固定的 CSS 重复背景?
我有一个基因行的数据集,其中的基因也成组。我希望根据一些条件为每组选择 1 个基因到一个新的数据框中:
direct_count
的基因secondary_count
的基因 Group Gene Score direct_count secondary_count
1 AQP11 0.5566507 4 5
1 CLNS1A 0.2811747 0 2
1 RSF1 0.5469924 3 6
2 CFDP1 0.4186066 1 2
2 CHST6 0.4295135 1 3
3 ACE 0.634 1 1
3 NOS2 0.6345 1 1
4 Gene1 0.1 10 20
4 Gene2 0.68 3 1
4 Gene3 0.7 0 1
每组基因的输出选择:
Group Gene Score direct_count secondary_count
1 AQP11 0.5566507 4 5 #highest direct_count
2 CHST6 0.4295135 1 3 #highest secondary_count after matching direct_count
3 ACE 0.634 1 1 #ACE and NOS2 have matching counts
3 NOS2 0.6345 1 1
我正在尝试使用
dplyr::group_by()
目前使用 if 语句。
structure(list(Group = c(1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 3L, 3L, 4L, 4L, 4L), Gene = c("AQP11",
"CLNS1A", "RSF1", "CFDP1", "CHST6", "ACE", "NOS2", "Gene1", "Gene2", "Gene3"), Score = c(0.5566507,
0.2811747, 0.5269924, 0.4186066, 0.4295135, 0.634, 0.6345, 0.1, 0.68, 0.7), direct_count = c(4L,
0L, 3L, 1L, 1L, 1L, 1L, 10L, 3L, 0L ), secondary_count = c(5L, 2L, 6L, 2L,
3L, 1L, 1L, 20L, 1L, 1L)), row.names = c(NA, -10L), class = c("data.table",
"data.frame"))
编辑:
direct_count
为 NA和
secondary_count
.
> sessionInfo()
R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 18362)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United Kingdom.1252
[2] LC_CTYPE=English_United Kingdom.1252
[3] LC_MONETARY=English_United Kingdom.1252
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United Kingdom.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] forcats_0.5.0 stringr_1.4.0 purrr_0.3.4 readr_1.4.0
[5] tibble_3.0.4 ggplot2_3.3.2 tidyverse_1.3.0 tidyr_1.1.2
[9] dplyr_1.0.2 data.table_1.13.2
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_1.0.5 cellranger_1.1.0 pillar_1.4.6 compiler_4.0.2
[5] dbplyr_1.4.4 tools_4.0.2 jsonlite_1.7.1 lubridate_1.7.9
[9] lifecycle_0.2.0 gtable_0.3.0 pkgconfig_2.0.3 rlang_0.4.8
[13] reprex_0.3.0 cli_2.1.0 DBI_1.1.0 rstudioapi_0.11
[17] haven_2.3.1 withr_2.3.0 xml2_1.3.2 httr_1.4.2
[21] fs_1.5.0 generics_0.0.2 vctrs_0.3.4 gtools_3.8.2
[25] hms_0.5.3 grid_4.0.2 tidyselect_1.1.0 glue_1.4.1
[29] R6_2.4.1 fansi_0.4.1 readxl_1.3.1 modelr_0.1.8
[33] blob_1.2.1 magrittr_1.5 backports_1.1.10 scales_1.1.1
[37] ellipsis_0.3.1 rvest_0.3.6 assertthat_0.2.1 colorspace_1.4-1
[41] stringi_1.5.3 munsell_0.5.0 broom_0.7.2 crayon_1.3.4
编辑真实数据选择问题:
structure(list(Group = c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L), Gene = c("CFDP1",
"CHST6", "RNU6-758P", "Gene1", "TMEM170A"), Score = c(0.551740109920502,
0.598918557167053, 0.564491391181946, 0.567291617393494, 0.616708278656006
), direct_count = c(1, 1, 0, 0, 0), secondary_count = c(62,
6, 1, 1, 2)), row.names = c(NA, -5L), class = c("data.table",
"data.frame"), .internal.selfref = <pointer: 0x00000183dc6b1ef0>)
来自本组
Gene1
在实际应该是
CHST6
时被选中我找不到原因。
Group Gene Score direct_count secondary_count
1 2 CFDP1 0.5517401 1 62
2 2 CHST6 0.5989186 1 6
3 2 RNU6-758P 0.5644914 0 1
4 2 Gene1 0.5672916 0 1
5 2 TMEM170A 0.6167083 0 2
CHST6最高
direct_count
在所有基因中 <0.05 到该组中得分最高的基因,但 Gene1 被选中。
最佳答案
group_by
和 filter
来自 tidyverse 是你的 friend 。
library(dplyr)
library(tidyr)
df <- structure(list(Group = c(1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 3L, 3L),
Gene = c("AQP11", "CLNS1A", "RSF1", "CFDP1", "CHST6", "ACE", "NOS2"), Score = c(0.5566507,0.2811747, 0.5269924, 0.4186066, 0.4295135, 0.634, 0.6345), direct_count = c(4L, 0L, 3L, 1L, 1L, 1L, 1L), secondary_count = c(5L, 2L, 6L, 2L,
3L, 1L, 1L)), row.names = c(NA, -7L), class = c("data.table", "data.frame"))
new_df <- df %>%
#first condition
group_by(Group) %>%
mutate(max_score_difference = abs(max(Score)-min(Score))) %>%
filter((max_score_difference > 0.02 & Score == max(Score)) | max_score_difference < 0.02) %>%
# second condition
filter(max_score_difference > 0.02 | (max_score_difference < 0.02 & direct_count == max(direct_count))) %>%
# third condition
filter(max_score_difference > 0.02 | (max_score_difference < 0.02 & secondary_count == max(secondary_count))) %>%
ungroup() %>%
#fourth condition met by max statements in filters above
select(-max_score_difference) %>%
data.frame()
print(new_df)
关于r - 从有条件的组中选择一行?,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/64488470/
是否有某种方法可以使用 JPA 或 Hibernate Crtiteria API 来表示这种 SQL?或者我应该将其作为 native 执行吗? SELECT A.X FROM (SELECT X,
在查询中, select id,name,feature,marks from (....) 我想删除其 id 在另一个 select 语句中存在的那些。 从 (...) 中选择 id 我是 sql
我想响应用户在 select 元素中选择一个项目。然而这个 jQuery: $('#platypusDropDown').select(function () { alert('You sel
这个问题在这里已经有了答案: SQL select only rows with max value on a column [duplicate] (27 个回答) 关闭8年前。 我正在学习 SQL
This question already has answers here: “Notice: Undefined variable”, “Notice: Undefined index”, and
我在 php 脚本中调用 SQL。有时“DE”中没有值,如果是这种情况我想从“EN”中获取值 应该是这样的,但不是这样的 IF (EXISTS (SELECT epf_application_deta
这可能是一个奇怪的问题,但不知道如何研究它。执行以下查询时: SELECT Foo.col1, Foo.col2, Foo.col3 FROM Foo INNER JOIN Bar ON
如何在使用 Camera.DestinationType.FILE_URI. 时在 phonegap camera API 中同时选择或拾取多个图像我能够一次只选择一张图像。我可以使用 this 在
这是一个纯粹的学术问题。这两个陈述实际上是否相同? IF EXISTS (SELECT TOP 1 1 FROM Table1) SELECT 1 ELSE SELECT 0 相对 IF EXIS
我使用 JSoup 来解析 HTML 响应。我有多个 Div 标签。我必须根据 ID 选择 Div 标签。 我的伪代码是这样的 Document divTag = Jsoup.connect(link
我正在处理一个具有多个选择框的表单。当用户从 selectbox1 中选择一个选项时,我需要 selectbox2 active 的另一个值。同样,当他选择 selectbox2 的另一个值时,我需要
Acme Inc. Christa Woods Charlotte Freeman Jeffrey Walton Ella Hubbard Se
我有一个login.html其中form定义如下: First Initial Plus Last Name : 我的do_authorize如下: "; pri
$.get( 'http://www.ufilme.ro/api/load/maron_online/470', function(data
我有一个下拉列表“磅”、“克”、“千克”和“盎司”。我想要这样一种情况,当我选择 gram 来执行一个函数时,当我在输入字段中输入一个值时,当我选择 pounds 时,我想要另一个函数来执行时我在输入
我有一个 GLSL 着色器,它从输入纹理的 channel 之一(例如 R)读取,然后写入输出纹理中的同一 channel 。该 channel 必须由用户选择。 我现在能想到的就是使用一个 int
我想根据下拉列表中的选定值生成输入文本框。 Options 2 3 4 5 就在这个选择框之后,一些输入字段应该按照选定的数字出现。 最佳答案 我建议您使用响应式(Reac
我是 SQL 新手,我想问一下如何根据首选项和分组选择条目。 +----------+----------+------+ | ENTRY_ID | ROUTE_ID | TYPE | +------
我有以下表结构: CREATE TABLE [dbo].[UTS_USERCLIENT_MAPPING_USER_LIST] ( [MAPPING_ID] [int] IDENTITY(1,1
我在移除不必要的床单时遇到了问题。我查看了不同的论坛并将不同的解决方案混合在一起。 此宏删除工作表(第一张工作表除外)。 Sub wrong() Dim sht As Object Applicati
我是一名优秀的程序员,十分优秀!