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我有大约 60 个 csv
我想合并的文件。一个挑战是列的命名不一致,尽管基本上所有文件(应该)具有相同的数据。
为了解决这个问题,我想首先测试哪些文件具有某些列名(哪些没有)。我有一个字符串向量,其中每个元素都反射(reflect)一个列名,要检查它是否存在于每个 csv 文件中。
我正在尝试实现一个具有以下功能的数据框:
0
或 1
标记csv文件是否有列名library(tidyverse)
df_1 <-
tribble(~ date, ~ name, ~ age, ~ gender,
"2020-11-29", "sarah", 43, "female")
df_2 <-
tribble(~ createdAt, ~ person, ~ age, ~ is_female,
"2020-10-10", "bob", 25, 0)
df_3 <-
tribble(~ date, ~ name, ~ age_value, ~ gender,
"2010-01-07", "wendy", 70, "female")
write_csv(df_1, "csv_1.csv")
write_csv(df_2, "csv_2.csv")
write_csv(df_3, "csv_3.csv")
带名字的矢量
date
,
name
,
age
,
age_value
,
gender
.
col_names_to_test <-
c(
"date",
"name",
"age",
"age_value",
"gender"
)
解决方案的基础
list.files
与
purrr::map_df
在定义的函数上。
read_plus <-
function(flnm) {
read_csv(flnm, col_types = cols(.default = "c")) # %>%
## here some testing against the vector `col_names_to_test` ?
}
tbl_with_sources <-
list.files(path = //folder-with-csv-files,
pattern = "*.csv",
full.names = TRUE,
recursive = TRUE) %>%
map_df(~ read_plus(.))
这只是一个普遍的想法......我习惯于 tidyverse 方法,但我会对任何解决方案感到满意。
filename date name age age_value gender
<chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 csv_1 1 1 1 0 1
2 csv_2 0 0 1 0 0
3 csv_3 1 0 0 1 1
最佳答案
定义一个函数 ok
其中给定的文件名 f
返回与 col_names_to_test
具有相同长度的命名 0/1 向量如果 col_names_to_test
的对应分量为 1在该文件中作为列名存在,否则为 0。然后定义一个文件名向量 files
.给它命名而不带扩展名并应用 ok
使用 map_dfr
.
这是相当紧凑的,并且只使用 purrr。
library(purrr)
ok <- function(f) +setNames(col_names_to_test %in% names(read.csv(f)), col_names_to_test)
files <- Sys.glob("csv_*.csv")
shortnames <- sub("\\.csv$", "", basename(files))
files %>% setNames(shortnames) %>% map_dfr(ok, .id = "file")
给予:
# A tibble: 3 x 6
file date name age age_value gender
<chr> <int> <int> <int> <int> <int>
1 csv_1 1 1 1 0 1
2 csv_2 0 0 1 0 0
3 csv_3 1 1 0 1 1
更新
关于r - 如何在多个 CSV 中测试某些列名是否存在,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/65060621/
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