从输出文件重定向，以便可以捕获

Question

一个程序foo写入输出文件并将诊断信息打印到 stdout .
因此:

foo -o ./out  -i ./input  > log

结果是 ./out 中的有值(value)的东西以及 log 中的一些笨拙的庞然大物.
我需要阅读 ./out进入另一个程序(我正在编写的 R 脚本)。
写入文件的中间步骤 ./out再次阅读很慢，我需要为大 ./out这样做文件，数百次。
我想执行某种重定向，以便 foo写入文件描述符而不是文件 ./out ，我可以直接读入我的脚本。但是 stdout已经使用。
这是我尝试过的:
在 R :

library(data.table)
fread(cmd = "foo -o /dev/stdout -i ./input > /dev/null")

但我收到一个错误:

  File '/data1/tmp/RtmpkKIpBm/fileeb789130da8e3' has size 0. Returning a NULL data.table.

Answer 1

foo -o >(cat)  -i ./input  > log

演示:

$ cat foo 
#!/bin/bash

if [ "$1" != "-o" ]; then
    exit 2
fi
echo "mumbo jumbo stdout" >&1
echo "valueable info" > "$2"
echo "mumbo jumbo stderr" >&2 # threw in stderr for good measure
$ ./foo -o x
mumbo jumbo stdout
mumbo jumbo stderr
$ cat x
valueable info
$ rm x
$ ./foo -o /dev/stdout
mumbo jumbo stdout
valueable info
mumbo jumbo stderr
$ ./foo -o /dev/stdout &>/dev/null
$ ./foo -o >(cat) &>/dev/null
valueable info

解释:
每个进程都有自己的标准输出。与 ./foo -o /dev/stdout &>/dev/null ，你在告诉 foo将其有值(value)的信息输出到自己的标准输出中，即 /dev/null .但与 ./foo -o >(cat) &>/dev/null ，你在告诉 foo将其有值(value)的信息输出到某个管道中，该管道转到 cat ，其标准输出不是 /dev/null ，而是从 shell 继承。
在演示中，shell 的标准输出是终端，但如果它来自 R 的 fread() ，shell 的标准输出和 cat的标准输出会去哪里 fread()可以阅读它们。