cluster-computing - 如何获得 SGE 工作状态

Question

这可能是个很简单的问题，但是如果我有job ID，我如何获取通过SGE提交的job的状态呢？我基本上想检查作业 ID，看看它是处于错误状态、仍在运行还是已完成。

我在想这样的事情

qstat -u '*' | grep 123456

但如果作业 ID 较低，它可能会返回我想要的行以外的行。并使用这样的命令...

qstat -j '123456'

...似乎没有返回作业状态。

Answer 1

发出命令:

qstat -xml

结果将采用 XML 格式。您可以解析结果并提取状态:

<job_list state="pending">
  <JB_job_number>3150728</JB_job_number>
  <JAT_prio>0.00000</JAT_prio>
  <JB_name>snpReference</JB_name>
  <JB_owner>me</JB_owner>
  <state>hqw</state>
  <JB_submission_time>2016-11-23T11:54:01</JB_submission_time>
  <queue_name></queue_name>
  <jclass_name></jclass_name>
  <slots>1</slots>
</job_list>