r - 让 R 停止它正在运行的 EC2 机器

Question

我有一些工作流程，我希望 R 在脚本完成后停止运行它的 Linux 机器。我可以想到两种类似的方法来做到这一点:

以 root 身份运行 R 然后调用 system("halt")

从 root shell 脚本运行 R(可以作为任何用户运行 R 脚本)然后让 shell 脚本运行 halt R位完成后。

还有其他简单的方法可以做到这一点吗？

这里的用例适用于在 AWS 上运行的脚本，我希望实例在脚本完成后停止，这样我就不会因作业运行后的机器时间而收费。我用于数据分析的实例是 EBS 支持的实例，因此我不想终止它，只需挂起即可。从实例内部发出暂停命令与从 AWS 控制台停止/暂停的效果相同。

Answer 1

我印象深刻。 (对于其他对实例可以自行停止感到惊讶的人，请参阅注释 1 和 2。)

您也可以尝试“sudo pause”，因为您不需要以 root 用户身份运行，只要运行 R 的用户帐户能够运行 sudo。这在 EC2 上的许多 AMI 上很常见。

注意什么构成了 R 退出的假设 - 不管你信不信，R 可能会崩溃。最好有一个单独的脚本来监视 R pid，一旦该 PID 不再事件，就终止实例。在 R 内部执行此命令意味着如果 R 崩溃，它永远不会调用停止。如果您从另一个脚本中调用它，那也可能很危险。如果您很了解 Linux，那么您要查找的是从 R 开始的 PID，您可以将其传递给另一个检查 ps 的脚本。 ，假设每 1 秒一次，然后在 PID 不再运行时终止实例。

我认为更好的解决方案是使用 EC2 API 工具(参见:http://docs.amazonwebservices.com/AWSEC2/latest/APIReference/ 文档)来终止或停止实例。这两者之间存在差异，重要的是您的实例是 EBS 支持还是 S3 支持。您无需以 root 身份运行即可终止实例 - 您拥有私钥和证书这一事实表明亚马逊您是 BOSS，远高于仅对您的实例具有 root 访问权限的 hoi polloi。

由于这些凭据可用于恶作剧，因此在从给定服务器运行 API 工具时要小心，您将需要服务器上的证书和私钥。如果您遇到安全问题，这是一个坏主意。最好向主服务器发送消息并让它关闭实例。如果您在实例之间以任何方式设置了消息传递，这可以为您完成所有工作。

注 1:埃里克·哈蒙德 reports halt只会暂停一个 EBS 实例，因此您仍然需要支付存储费用。如果您碰巧启动了很多这样的实例，这可能会使事情变得困惑。您最初的问题似乎不清楚您是要终止还是停止实例。他还有其他好的建议on this page

注 2:A short thread on the EC2 developers forum为 Linux 和 Windows 用户提供建议。

注意 3:EBS 实例按部分小时数计费，即使重新启动也是如此。 (请参阅 this thread from the developer forum 。)在接近小时标记的自动挂起可能很有用，假设 R 进程不工作，以防有人可能重新分配该实例(即节省不重新启动)。其他需要考虑的有用工具:setTimeLimit和 setSessionTimeLimit ，以及各种检查点工具(我有一个 Q 是 mentions a couple )。如果代码有潜在的不良行为，则使用自动终止很有用。

注4:我最近了解到shutdown包中的命令 fun .这是多平台的。见 this blog post用于评论，代码为 here .危险的东西，但如果你想适应 Windows，它可能很有用。不过我没试过。

更新 1。另外三个想法:

您可以使用 .Last()和 runLast = TRUE为 q()和 quit() ，这可能会关闭实例。

如果使用 littler 或通过 Rscript 调用脚本的脚本，则可以使用相同的命令行函数。

我今天最喜欢的包，tcltk2有一个简洁的计时器机制，称为 tclTaskSchedule()可用于调度表达式的执行。然后，您可能会在每小时间隔过去之前对执行内容感到疯狂。