r - 如何在R中创建tar.gz文件？

Question

我会从R创建一个tar.gz文件。但是tar函数对我不起作用。这是我的示例代码。

writeLines('aaaa', 'tmp.txt')
tar('tmp.tar.gz', 'tmp.txt', compression = 'gzip')

这段代码创建了一个tmp.tar.gz，但tmp.txt不包含在gz文件中。

我的代码中有任何错误吗？

感谢您的任何建议。

我在Windows和Linux中运行以下代码:

#Windows platform
sessionInfo()
R version 3.1.0 (2014-04-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Australia.1252  LC_CTYPE=English_Australia.1252   
[3] LC_MONETARY=English_Australia.1252 LC_NUMERIC=C                      
[5] LC_TIME=English_Australia.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.1.0

#Linux platform
sessionInfo()
R version 3.1.0 (2014-04-10)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C         LC_TIME=C            LC_COLLATE=C        
 [5] LC_MONETARY=C        LC_MESSAGES=C        LC_PAPER=C           LC_NAME=C           
 [9] LC_ADDRESS=C         LC_TELEPHONE=C       LC_MEASUREMENT=C     LC_IDENTIFICATION=C 

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] weaana_0.1.0.3874  abind_1.4-0        reshape2_1.4       ncdf4cf_0.1.0.3698 ncdf4_1.10        
[6] stringr_0.6.2      My_0.1.0.4086     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_0.11.1 plyr_1.8.1  tools_3.1.0

Answer 1

我想您尚未设置"tar"环境变量。 tar()的默认参数称为tar是通过调用Sys.getenv("tar")来设置的。如果它是一个空字符串，则使用R的内部tar(在我的系统上也不起作用)。

因此，您可以使用Sys.setenv或"tar"变量，也可以手动提供外部tar命令/路径的名称:

tar('tmp.tar.gz', 'tmp.txt', compression = 'gzip', tar="tar")