r - 矩阵的子集 as.numeric in R for log2

Question

我有一个 54675 obs 的数据矩阵( data )。 170 个变量。我想表演

data.matrix.2 <- log2(data[,9:ncol(data)]) 

即对于第 9 列及以后的值。之前的 8 列是字符。我收到以下错误

Error in Math.data.frame(data.matrix[, 9:ncol(data)]) : 
  non-numeric variable in data frame: 

有没有办法将矩阵的子集视为对数变换的数字。

谢谢

Answer 1

我的第一个想法是你已经得到了一个字符矩阵并且需要:

as.numeric(data.matrix.2[ , -(1:8) ])

...但 data.matrix() 应该强制为“数字”模式。哦，不，你去吧。您没有使用 data.matrix 函数......所以最好不要使用名称“data.matrix”，因为这也是 R 函数的名称。

您正确使用了“[,]”，因此您对数据对象的假设可能存在缺陷。在剩余的 162 列中必须有一列数据被创建为因子或字符。您需要运行 str(data.matrix) 以查看它/它们是哪一个。