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我正在Rcpp
中开发一些对big.matrix
包中的bigmemory
对象进行操作的函数。这些对象作为Rcpp
对象传递给SEXP
,然后我必须将它们转换为XPtr<BigMatrix>
,然后转换为MatrixAccessor
对象以访问矩阵的元素。
例如,如果我想实现一个以对角线表示的函数:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::depends(BH, bigmemory)
#include <bigmemory/MatrixAccessor.hpp>
#include <numeric>
// [[Rcpp::export]]
NumericVector GetDiag(SEXP pmat) {
XPtr<BigMatrix> xpMat(pMat); // allows you to access attributes
MatrixAccessor<double> mat(*xpMat); // allows you to access matrix elements
NumericVector diag(xpMat->nrow()); // Assume matrix is square
for (int i = 0; i < xpMat->nrow(); i++) {
diag[i] = mat[i][i];
}
return diag;
}
big.matrix
对象用 double 填充,此函数就可以很好地工作。
diag(as.big.matrix(matrix(1:9, 3))@address)
)上调用此函数,则结果会产生垃圾,因为
MatrixAccessor
已初始化为
<double>
。
big.matrix
对象可以分为四种类型:
void typeof(SEXP pMat) {
XPtr<BigMatrix> xpMat(pMat);
int type = xpMat->matrix_type();
type == 1 // char
type == 2 // short
type == 4 // int
type == 8 // double
}
diag
函数应该能够处理所有这些类型。但是现在,由于我们的函数签名是
NumericVector
,所以我将忽略字符矩阵。
mat
:
// [[Rcpp::export]]
NumericVector GetDiag(SEXP pmat) {
XPtr<BigMatrix> xpMat(pMat);
// Determine the typeof(pmat), and initialize accordingly:
switch(xpMat->matrix_type()) {
case == 1:
{
// Function expects to return a NumericVector.
throw;
}
case == 2:
{
MatrixAccessor<short> mat(*xpMat);
break;
}
case == 4:
{
MatrixAccessor<int> mat(*xpMat);
break;
}
case == 8:
{
MatrixAccessor<double> mat(*xpMat);
}
}
MatrixAccessor<double> mat(*xpMat); // allows you to access matrix elements
NumericVector diag(xpMat->nrow()); // Assume matrix is square
for (int i = 0; i < xpMat->nrow(); i++) {
diag[i] = mat[i][i];
}
return diag;
}
mat
中已经声明了
case
之后,我要重新定义它。
diag
函数,每种函数一个,除
mat
的初始化外,其代码均相同。有没有更好的办法?
最佳答案
在这些情况下,通常需要分离逻辑:首先,您具有一个将SEXP
类型编码为某种编译时类型的调度函数,以及一个用于处理实际工作的单独(模板化)函数。一些(不完整的)示例代码:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// the actual generic implementation
template <typename T>
T GetDiag_impl(T const& pMat) {
// logic goes here
}
// the dispatch code
// [[Rcpp::export]]
SEXP GetDiag(SEXP pMat) {
switch (TYPEOF(pMat)) {
case INTSXP: return GetDiag_impl<IntegerMatrix>(pMat);
case REALSXP: return GetDiag_impl<NumericMatrix>(pMat);
<...>
}
}
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