R 格子 - 尝试使用 y.scale.components 自定义更改标签颜色

Question

我目前尝试通过更改其 Y 轴标签颜色来自定义格子平行图，具体取决于这些相同标签的特征。我创建了一个自定义的 y.scale.components 函数，如许多书籍/论坛中所述。但是，在将新颜色向量分配给 ans$left$labels$col 参数后，绘图仅使用默认颜色(黑色)。

这是代码:

test2 <- read.table(textConnection("

         species  evalue l1 l2  l3
   Daphnia.pulex  1.0E-6 17 41  35
   Daphnia.pulex 1.0E-10 11 30  25
   Daphnia.pulex 1.0E-20  4 14  17
   Daphnia.pulex 1.0E-35  4  8  15
   Daphnia.pulex 1.0E-50  1  4   8
   Daphnia.pulex 1.0E-75  0  2   6
Ixodes.scapularis  1.0E-6  7 20 118
Ixodes.scapularis 1.0E-10  6 17 107
Ixodes.scapularis 1.0E-20  4  6  46
Ixodes.scapularis 1.0E-35  2  3  14
Ixodes.scapularis 1.0E-50  0  0   5
Ixodes.scapularis 1.0E-75  0  0   2
")->con,header=T);close(con)

#data.frame to assign a color to the data, depending on species names on y axis
orga<-c("Daphnia.pulex","Ixodes.scapularis")
color<-c("cornsilk2","darkolivegreen1" );
phylum<-c("arthropoda","arthropoda" );
colorChooser<-data.frame(orga,color,phylum)

#fonction for custom rendering of left y axis labels 
yscale.components.custom<-function(...) {
  ans<-yscale.components.default(...)
  #vector for new label colors, grey60 by default
  new_colors<-c()
  new_colors<-rep("grey60",length(ans$left$labels$labels))
  # the for() check all labels character and assign the corresponding color with the colorChooser data.frame
  n<-1
  for (i in ans$left$labels$labels) {
      new_colors[n]<-as.character(colorChooser$color[colorChooser$orga==i])
      #got the color corresponding to the label, with the colorChooser dataframe
  n<-n+1
  }
  print(length(new_colors))
  cat(new_colors,sep="\n")  #print the content of the generated color vector
  ans$left$labels$col<-new_colors  #assign this vector to col parameter
  ans
}

#plot everything
bwplot(   reorder(species,l1,median)~l1,
      data=test2,
      panel = function(..., box.ratio) {
            panel.grid(h=length(colnames(cdata[,annot.arthro]))-1,v=0,col.line="grey80")
            panel.violin(..., col = "white",varwidth = FALSE, box.ratio = box.ratio )
            panel.bwplot(..., fill = NULL, box.ratio = .07)
      },
      yscale.components=yscale.components.custom
)

这是 cat() 命令的输出，包含在 yscale.components.custom 函数中。如您所见，它输出两倍的颜色标签，但分配给 ans$left$labels$col 的向量长度为​​ 2。是否有第二个调用设置 Y 轴标签颜色？它来自哪里？

[1] 2
darkolivegreen1
cornsilk2
[1] 2
darkolivegreen1
cornsilk2

欢迎任何帮助，我不明白为什么将颜色分配给 ans$left$labels$col 但所有内容都是用黑色绘制的。我还想更改 fiddle 边框颜色，使用相同的 colorChooser data.frame，但那是另一回事了...

Answer 1

在向 Deepayan Sarkar 询问后， ans$left$labels$col 值显然在格子执行过程中被忽略了。

我使用了带有“scales”参数的不同解决方案。不幸的是，我不能再依靠格重新排序函数来按中位数重新排序我的数据系列。

对于上面提到的代码，我手动对它们进行排序，然后创建一个具有相应顺序的颜色向量。我不能再依赖格子重新排序(格子公式中的“重新排序”)。然后，我设置我的 axix 标签颜色

scales=list(col=c(color1,color2,...))