r - 如何在ggplot2 qplot上叠加经过修改的黄土线？

Question

背景

现在，我正在创建一个多预测器线性模型，并生成诊断图以评估回归假设。 (这是我目前钟爱的多元回归分析统计信息类:-)

我的教科书(Cohen，Cohen，West和Aiken，2003年)建议针对残差绘制每个预测变量，以确保:

残差与预测变量

不会系统地平移

相对于

模型中的每个预测变量，残差是同质的

关于第(2)点，我的教科书上写着:

Some statistical packages allow the analyst to plot lowess fit lines at the mean of the residuals (0-line), 1 standard deviation above the mean, and 1 standard deviation below the mean of the residuals....In the present case {their example}, the two lines {mean + 1sd and mean - 1sd} remain roughly parallel to the lowess {0} line, consistent with the interpretation that the variance of the residuals does not change as a function of X. (p. 131)

如何修改黄土线？

我知道如何生成带有“0行”的散点图:

    # First, I'll make a simple linear model and get its diagnostic stats
    library(ggplot2)
    data(cars)
    mod <- fortify(lm(speed ~ dist, data = cars))
    attach(mod)
    str(mod)

    # Now I want to make sure the residuals are homoscedastic
    qplot (x = dist, y = .resid, data = mod) + 
    geom_smooth(se = FALSE) # "se = FALSE" Removes the standard error bands

但是，有谁知道我如何使用 ggplot2和 qplot生成将叠加0线，“均值+ 1sd”和“均值-1sd”线的图？这是一个很奇怪/复杂的问题吗？

Answer 1

道歉

亲爱的，我要为自己的无知向您道歉。哈德利绝对是正确的，答案一直就在我面前。正如我所怀疑的那样，我的问题是统计上的而不是程序上的无知。

我们免费获得68％的置信区间
geom_smooth()默认为loess平滑，并且在处理过程中将+ 1sd和-1sd线叠加在一起。这就是哈德利(Hadley)说的意思:“这不只是68％的置信区间吗？”我只是完全忘记了68％的间隔，并一直在寻找我已经知道该怎么做的东西。通过指定geom_smooth(se = FALSE)实际上关闭了代码中的置信区间并没有帮助。

我的示例代码应该看起来像什么

# First, I'll make a simple linear model and get its diagnostic stats.
library(ggplot2)
data(cars)
mod <- fortify(lm(speed ~ dist, data = cars))
attach(mod)
str(mod)

# Now I want to make sure the residuals are homoscedastic.
# By default, geom_smooth is loess and includes the 68% standard error bands.
qplot (x = dist, y = .resid, data = mod) + 
geom_abline(slope = 0, intercept = 0) +
geom_smooth() 

我学到了什么

哈德利(Hadley)实现了一种非常漂亮，简单的方法来获得我一直想要的东西。但是因为我专注于黄土线，所以我没有看到68％的置信区间受我需要的线限制的事实。抱歉给大家带来麻烦。