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首先让我说我是 R 的新手,并试图弄清楚如何在我的特定数据集上运行 icc,这可能与正常情况下有点不同。
数据集如下所示
+------------+------------------+--------------+--------------+--------------+
| date | measurement_type | measurement1 | measurement2 | measurement3 |
+------------+------------------+--------------+--------------+--------------+
| 25-04-2020 | 1 | 15.5 | 34.3 | 43.2 |
| 25-04-2020 | 2 | 21.2 | 12.3 | 2.2 |
| 25-04-2020 | 3 | 16.2 | 9.6 | 43.3 |
| 25-04-2020 | 4 | 27 | 1 | 6 |
+------------+------------------+--------------+--------------+--------------+
现在我想对所有这些行进行 icc,因为每一行代表不同的评分者。它应该保留 date
和 measurement_type
列。
有人能给我指出正确的方向吗,我完全不知道该怎么做。
-------- 编辑 --------
我导出了将带有一些测试数据的实际数据集。哪个可用here
这里有两张重要的纸是第一张和第三张。第一个包含研究的所有参与者,第三个包含每个参与者的所有 4 份不同报告。到目前为止,我所拥有的代码只是将每个报告与正确的参与者联系起来;
library("XLConnect")
library("sqldf")
library("irr")
library("dplyr")
library("tidyr")
# Load in Workbook
wb = loadWorkbook("Measuring.xlsx")
# Load in Worksheet
# Sheet 1 = Study Results
# Sheet 3 = Meetpunten
records = readWorksheet(wb, sheet=1)
reports = readWorksheet(wb, sheet=3)
for (record in 1:nrow(records)) {
recordId = records[record, 'Record.Id']
participantReports = sqldf(sprintf("select * from reports where `Record.Id` = '%s'", recordId))
baselineReport = sqldf("select * from participantReports where measurement_type = '1'")
drinkReport = sqldf("select * from participantReports where measurement_type = '2'")
regularReport = sqldf("select * from participantReports where measurement_type = '3'")
exerciseReport = sqldf("select * from participantReports where measurement_type = '4'")
}
最佳答案
由于在您的数据中,每一行代表不同的评分者,但 irr 包中的 icc 函数需要评分者为列,您可以忽略表的前两列,转置它并运行 icc。
所以,假设这个表:
+------------+------------------+--------------+--------------+--------------+
| date | measurement_type | measurement1 | measurement2 | measurement3 |
+------------+------------------+--------------+--------------+--------------+
| 25-04-2020 | 1 | 15.5 | 34.3 | 43.2 |
| 25-04-2020 | 2 | 21.2 | 12.3 | 2.2 |
| 25-04-2020 | 3 | 16.2 | 9.6 | 43.3 |
| 25-04-2020 | 4 | 27 | 1 | 6 |
+------------+------------------+--------------+--------------+--------------+
存储在一个名为data
的变量中,我会这样做:
data2 = data.matrix(data[,-c(1,2)]) # generates the dataset without the first two columns
data2
是这张表:
+--------------+--------------+--------------+
| measurement1 | measurement2 | measurement3 |
+--------------+--------------+--------------+
| 15.5 | 34.3 | 43.2 |
| 21.2 | 12.3 | 2.2 |
| 16.2 | 9.6 | 43.3 |
| 27 | 1 | 6 |
+--------------+--------------+--------------+
然后:
data2 = t(data2) # transpose data2 so as to have raters in the columns and their ratings in each line
icc(data2) # here i'm not bothering with the parameters, but you should explore the appropriate icc parameters for your needs.
应该生成正确的运行。
关于r - 数据框上的 icc,每个评分者都有行,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/61511266/
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