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r - 负指数拟合: curve looks too high

转载 作者:行者123 更新时间:2023-12-04 03:50:16 25 4
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我正在尝试对R中的某些数据拟合负指数,但与数据相比,拟合线看起来太高,而我使用Excel的内置幂拟合得到的拟合看起来更可信。有人可以告诉我为什么吗?我尝试使用nls()函数和optim()并从这两种方法中获取相似的参数,但两者的拟合度很高。

   x    <- c(5.96, 12.86, 8.40, 2.03, 12.84, 21.44, 21.45, 19.97, 8.92, 25.00, 19.90, 20.00, 20.70, 16.68, 14.90, 26.00, 22.00, 22.00, 10.00, 5.70, 5.40, 3.20, 7.60, 0.59, 0.14, 0.85, 9.20, 0.79, 1.40, 2.68, 1.91)
y <- c(5.35, 2.38, 1.77, 1.87, 1.47, 3.27, 2.01, 0.52, 2.72, 0.85, 1.60, 1.37, 1.48, 0.39, 2.39, 1.83, 0.71, 1.24, 3.14, 2.16, 2.22, 11.50, 8.32, 38.98, 16.78, 32.66, 3.89, 1.89, 8.71, 9.74, 23.14)

xy.frame <- data.frame(x,y)

nl.fit <- nls(formula=(y ~ a * x^b), data=xy.frame, start = c(a=10, b=-0.7))

a.est <- coef(nl.fit)[1]
b.est <- coef(nl.fit)[2]

plot(x=xy.frame$x,y=xy.frame$y)

# curve looks too high
curve(a.est * x^b.est , add=T)
# these parameters from Excel seem to fit better
curve(10.495 * x^-0.655, add=T)

enter image description here
    # alternatively use optim()
theta.init <- c(1000,-0.5, 50)

exp.nll <- function(theta, data){
a <- theta[1]
b <- theta[2]
sigma <- theta[3]
obs.y <- data$y
x <- data$x
pred.y <- a*x^b
nll <- -sum(dnorm(x=obs.y, mean=pred.y , sd=sigma, log=T))
nll
}

fit.optim <- optim(par=theta.init,fn=exp.nll,method="BFGS",data=xy.frame )

plot(x=xy.frame$x,y=xy.frame$y)

# still looks too high
curve(a.est * x^b.est, add=T)

enter image description here

最佳答案

您看到意外行为的原因是,看起来“太高”的曲线实际上具有比excel曲线低的平方误差总和:

# Fit from nls
sum((y - a.est*x^b.est)^2)
# [1] 1588.313

# Fit from excel
sum((y - 10.495*x^ -0.655)^2)
# [1] 1981.561

nls偏爱较高曲线的原因是,它可以避免在x值小的情况下出现巨大误差,但会以x值较大的较大误差为代价。解决此问题的一种方法可能是应用对数-对数转换:
mod <- lm(log(y)~log(x))
(a.est2 <- exp(coef(mod)["(Intercept)"]))
# (Intercept)
# 10.45614
(b.est2 <- coef(mod)["log(x)"])
# log(x)
# -0.6529741

这些与excel的系数非常接近,并且产生了更具视觉吸引力的拟合度(尽管平方误差和度量标准的性能较差):

enter image description here

关于r - 负指数拟合: curve looks too high,我们在Stack Overflow上找到一个类似的问题: https://stackoverflow.com/questions/33247152/

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